43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4844 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4844  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 410 aa  833    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3742  VWA containing CoxE family protein  78.29 
 
 		 403 aa  604  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3514  VWA domain-containing protein  71.43 
 
 		 389 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1510  VWA containing CoxE family protein  67.65 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1510  VWA containing CoxE family protein  67.47 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1789  VWA containing CoxE family protein  66.4 
 
 		 387 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2431  VWA containing CoxE family protein  61.5 
 
 		 403 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00243334  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6471  VWA containing CoxE family protein  63.3 
 
 		 385 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451364  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4024  VWA containing CoxE family protein  59.84 
 
 		 401 aa  475  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  60.1 
 
 		 400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4578  VWA containing CoxE family protein  60.42 
 
 		 390 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0754  VWA containing CoxE family protein  55.61 
 
 		 376 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  59.73 
 
 		 391 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  58.02 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2409  VWA containing CoxE family protein  58.89 
 
 		 393 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000612945  decreased coverage  0.0000832829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1840  VWA containing CoxE family protein  63.12 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  56.08 
 
 		 421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  57.22 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  58.68 
 
 		 552 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1279  VWA containing CoxE family protein  56.42 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.596835  hitchhiker  0.00435359 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0406  VWA containing CoxE family protein  47.37 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7544  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  39.89 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1885  VWA containing CoxE family protein  40.93 
 
 		 368 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1393  VWA containing CoxE family protein  40.16 
 
 		 376 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0792049  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  39.95 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0601  VWA containing CoxE family protein  38.05 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.46 
 
 		 378 aa  245  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0134  VWA containing CoxE family protein  36.31 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02050  hypothetical protein  36.19 
 
 		 378 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02008  hypothetical protein  36.19 
 
 		 378 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1361  VWA containing CoxE family protein  32.35 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3108  von Willebrand factor type A domain protein  35.92 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.708549  normal  0.744851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1537  VWA containing CoxE family protein  36.31 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0923  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.92 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2409  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.66 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  37.84 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  38.4 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3408  VWA containing CoxE family protein  35.69 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3885  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1330 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0169004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2512  VWA containing CoxE family protein  30.26 
 
 		 1295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2928  VWA containing CoxE family protein  31.14 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84121  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2018  VWA containing CoxE family protein  31.11 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.531693  normal  0.264381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0028  hypothetical protein  30.32 
 
 		 481 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125752  normal  0.588325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>