76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3140 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  74.52 
 
 		 475 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  75.94 
 
 		 496 aa  718    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  72.91 
 
 		 474 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  100 
 
 		 477 aa  943    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  71.66 
 
 		 480 aa  634    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  81.28 
 
 		 479 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  71.95 
 
 		 480 aa  628  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  59.96 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  62.5 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  60.21 
 
 		 476 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  59.57 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  61.37 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  60.54 
 
 		 476 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  60.54 
 
 		 476 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  62.33 
 
 		 502 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  62.56 
 
 		 502 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  62.33 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  62.33 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  62.33 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  62.33 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  62.33 
 
 		 524 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  63.8 
 
 		 488 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  61.93 
 
 		 476 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  61.28 
 
 		 476 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  59.78 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  60.04 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  61.97 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  59.82 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  61.45 
 
 		 475 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  60.17 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  59.17 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  59.87 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  58.74 
 
 		 471 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  58.63 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  58.94 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  56.63 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  60.75 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  60.53 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  58.98 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  59.28 
 
 		 486 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  59 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  57.49 
 
 		 447 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  57.05 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  54.3 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  54.5 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  53.95 
 
 		 485 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  51.92 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  50.95 
 
 		 469 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  50.9 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  51.03 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  48.54 
 
 		 465 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  48.25 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  40.61 
 
 		 495 aa  285  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  41.43 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  43.12 
 
 		 477 aa  279  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  42.36 
 
 		 424 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  40.93 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  40.62 
 
 		 486 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  39.78 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  39.4 
 
 		 488 aa  263  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  39.22 
 
 		 491 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  41.65 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  39.48 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  39.96 
 
 		 467 aa  242  9e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  23.71 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  24.37 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.78 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24 
 
 		 421 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.27 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.9 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  25.96 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.58 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  24.09 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  23.79 
 
 		 577 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.28 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>