64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1726 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  73.15 
 
 
497 aa  671    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  70.64 
 
 
495 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  70.33 
 
 
491 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  78.25 
 
 
486 aa  707    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  72.33 
 
 
488 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  925    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  61.51 
 
 
461 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  56.31 
 
 
512 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  50.33 
 
 
514 aa  424  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  44.62 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  39.87 
 
 
469 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  41.08 
 
 
485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  41.94 
 
 
502 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  39.46 
 
 
467 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  41.11 
 
 
465 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  38.94 
 
 
480 aa  267  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  38.84 
 
 
480 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  38.84 
 
 
475 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  39.43 
 
 
479 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  37.28 
 
 
469 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  38.1 
 
 
496 aa  247  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  37.17 
 
 
476 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  40.13 
 
 
477 aa  246  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  37.32 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  37.28 
 
 
469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  40.49 
 
 
496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  37.2 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  37.2 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  38.28 
 
 
474 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  38.33 
 
 
477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  36.56 
 
 
476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  37.36 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  36.92 
 
 
471 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  38.36 
 
 
470 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  37.15 
 
 
480 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  37.15 
 
 
480 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  37.15 
 
 
480 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  37.15 
 
 
480 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  37.34 
 
 
524 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  36.5 
 
 
476 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  37.15 
 
 
502 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  37.15 
 
 
502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  37.22 
 
 
474 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  34.07 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  36.94 
 
 
476 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  37.61 
 
 
476 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  36.83 
 
 
476 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  37.07 
 
 
467 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  37.28 
 
 
468 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  37.84 
 
 
477 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  36.34 
 
 
475 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  37.23 
 
 
471 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  37.79 
 
 
488 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  39 
 
 
478 aa  222  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  38.1 
 
 
471 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  36.7 
 
 
470 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  35.78 
 
 
478 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  37.64 
 
 
471 aa  217  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  37.8 
 
 
447 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  36.88 
 
 
476 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  35.39 
 
 
450 aa  199  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  36.33 
 
 
486 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  33.76 
 
 
477 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  33.49 
 
 
424 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>