92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3299 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  46.58 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  45.03 
 
 		 491 aa  356  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  45.31 
 
 		 495 aa  356  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  45.78 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  45.51 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  43.37 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  44.7 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  44.72 
 
 		 514 aa  339  5e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  44.06 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  44.7 
 
 		 465 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  39.74 
 
 		 502 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  40.22 
 
 		 470 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  40.76 
 
 		 477 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  42.66 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  38.89 
 
 		 469 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  38.58 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  37.47 
 
 		 474 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  38.83 
 
 		 485 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  39.91 
 
 		 468 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  38.13 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  37.9 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  37.9 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  38.66 
 
 		 475 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  37.92 
 
 		 475 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  37.47 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  38.97 
 
 		 480 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  38.75 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  37.99 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  37.26 
 
 		 476 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  37.2 
 
 		 476 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  38.41 
 
 		 479 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  39.65 
 
 		 477 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  40.66 
 
 		 478 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  37.1 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  38.2 
 
 		 476 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  37.28 
 
 		 480 aa  256  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  37.47 
 
 		 474 aa  255  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  39.49 
 
 		 471 aa  254  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  38.46 
 
 		 480 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  38.46 
 
 		 480 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  38.46 
 
 		 480 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  38.46 
 
 		 480 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  36.5 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  38.25 
 
 		 502 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  41.01 
 
 		 488 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  36.57 
 
 		 469 aa  253  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  38.25 
 
 		 502 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  38.25 
 
 		 524 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  39.03 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  36.57 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  39.26 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  37.74 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  37.42 
 
 		 476 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  38.37 
 
 		 476 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  39.29 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  38.68 
 
 		 467 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  37.75 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  36.94 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  39.14 
 
 		 447 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  37.28 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  34.73 
 
 		 486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  34.21 
 
 		 477 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  33.48 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  28.45 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  26.57 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.92 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  24.36 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  25.9 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  25.97 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  25.67 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  26.71 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  26.35 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  25 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  25.62 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  25 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  25.31 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  25.67 
 
 		 441 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  25.6 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.45 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  25.31 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  25.97 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  25.31 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  25.6 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.08 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  25.67 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  25.67 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  25.67 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  25.67 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  31.18 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>