71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2871 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  79.62 
 
 
476 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  86.76 
 
 
476 aa  794    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  86.34 
 
 
476 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  88.24 
 
 
476 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  99.79 
 
 
480 aa  938    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  100 
 
 
502 aa  983    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  99.4 
 
 
502 aa  979    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  99.79 
 
 
480 aa  938    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  99.79 
 
 
480 aa  938    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  86.55 
 
 
476 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  88.03 
 
 
476 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  86.55 
 
 
476 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  80.04 
 
 
476 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  99.79 
 
 
480 aa  938    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  99.8 
 
 
524 aa  983    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  86.34 
 
 
476 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  97.33 
 
 
467 aa  827    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  68.88 
 
 
474 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  76.04 
 
 
486 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  67.84 
 
 
469 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  67.4 
 
 
469 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  65.49 
 
 
470 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  67.93 
 
 
476 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  66.81 
 
 
478 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  64.21 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  64.05 
 
 
467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  65.49 
 
 
468 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  63.96 
 
 
478 aa  565  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  66.16 
 
 
475 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  62.2 
 
 
479 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  63.6 
 
 
477 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  65.3 
 
 
471 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  64.87 
 
 
471 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  66.23 
 
 
470 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  61.97 
 
 
496 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  60.69 
 
 
475 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  62.17 
 
 
477 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  62.19 
 
 
488 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  55.58 
 
 
480 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  56.91 
 
 
480 aa  508  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  59.64 
 
 
474 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  57.31 
 
 
476 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  56.81 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  59.02 
 
 
447 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  54.24 
 
 
471 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  54 
 
 
477 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  46.4 
 
 
469 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  46.72 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  45.32 
 
 
502 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  49.21 
 
 
450 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  47.42 
 
 
465 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  45.12 
 
 
496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  43.48 
 
 
424 aa  279  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  41.74 
 
 
477 aa  269  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  38.32 
 
 
495 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  39.44 
 
 
514 aa  261  2e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  40.3 
 
 
491 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  39.18 
 
 
461 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  37.18 
 
 
452 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  38.91 
 
 
488 aa  256  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  39.01 
 
 
497 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  37.14 
 
 
486 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  39.47 
 
 
512 aa  246  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  36.84 
 
 
467 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  25.58 
 
 
427 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.24 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  25.73 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  26.44 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  24.06 
 
 
423 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  27.39 
 
 
440 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  24.31 
 
 
423 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>