69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1990 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  928    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  71.02 
 
 		 468 aa  643    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  79.25 
 
 		 478 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  69.3 
 
 		 470 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  70.91 
 
 		 477 aa  628  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  71.19 
 
 		 470 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  70.21 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  70 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  69.63 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  63.42 
 
 		 476 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  63.85 
 
 		 476 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  65.32 
 
 		 476 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  64.8 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  64.8 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  65.94 
 
 		 474 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  63.52 
 
 		 476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  65.15 
 
 		 476 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  64.57 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  64.35 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  64.35 
 
 		 524 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  64.35 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  64.35 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  64.35 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  64.35 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  63.44 
 
 		 469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  62.94 
 
 		 476 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  62.78 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  64.73 
 
 		 467 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  67.2 
 
 		 476 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  61.12 
 
 		 478 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  63.33 
 
 		 486 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  62.39 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  59.28 
 
 		 467 aa  535  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  56.49 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  56.16 
 
 		 479 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  57.62 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  53.88 
 
 		 475 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  58.54 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  55.89 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  53.18 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  52.23 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  55.43 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  54.97 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  55.83 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  53.09 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  49.78 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  52.06 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  48.88 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  45.36 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  44.67 
 
 		 502 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  46.02 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  44.91 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  42.96 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  38.24 
 
 		 477 aa  253  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  38.51 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  36.99 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  39.05 
 
 		 497 aa  249  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  37.09 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  38.55 
 
 		 512 aa  246  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  37.63 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  38.85 
 
 		 486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  36.83 
 
 		 491 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  37.18 
 
 		 461 aa  236  6e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  36.87 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  23.95 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  23.03 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  26.15 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  25.26 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  24.5 
 
 		 427 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>