64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0354 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  961    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  71.09 
 
 		 495 aa  677    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  78.25 
 
 		 467 aa  676    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  72.13 
 
 		 497 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  74.17 
 
 		 488 aa  716    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  74.55 
 
 		 491 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  62.11 
 
 		 461 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  55.23 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  48.7 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  44.62 
 
 		 452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  40.53 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  40.69 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  40.33 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  40.3 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  41.04 
 
 		 502 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  38.54 
 
 		 480 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  39.84 
 
 		 479 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  38.51 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  40.62 
 
 		 477 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  38.53 
 
 		 471 aa  261  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  37.96 
 
 		 469 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  38.56 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  38.18 
 
 		 469 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  38.49 
 
 		 475 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  40 
 
 		 474 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  40.99 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  40.38 
 
 		 470 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  38.15 
 
 		 476 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  38.78 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  38.78 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  41.22 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  37.92 
 
 		 476 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  36.92 
 
 		 476 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  40.77 
 
 		 476 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  38.88 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  38.01 
 
 		 476 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  38.27 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  37.44 
 
 		 474 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  37.31 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  39.36 
 
 		 471 aa  240  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  36.75 
 
 		 476 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  39.27 
 
 		 468 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  37.66 
 
 		 476 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  37.83 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  37.83 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  38.04 
 
 		 524 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  37.83 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  37.83 
 
 		 502 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  37.83 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  37.83 
 
 		 502 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  39.54 
 
 		 488 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  38.37 
 
 		 477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  34 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  37.17 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  39.26 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  39.11 
 
 		 471 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  38.69 
 
 		 471 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  38.77 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  36.77 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  36.05 
 
 		 470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  38.43 
 
 		 450 aa  217  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  34.79 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  33.98 
 
 		 477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  34.89 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>