68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0982 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  88.24 
 
 		 480 aa  771    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  94.12 
 
 		 476 aa  842    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  94.75 
 
 		 476 aa  890    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  100 
 
 		 476 aa  926    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  80.46 
 
 		 476 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  88.24 
 
 		 480 aa  771    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  88.24 
 
 		 502 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  87.82 
 
 		 502 aa  771    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  88.24 
 
 		 480 aa  771    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  88.24 
 
 		 480 aa  771    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  94.75 
 
 		 476 aa  864    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  98.74 
 
 		 476 aa  916    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  94.75 
 
 		 476 aa  864    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  88.39 
 
 		 467 aa  747    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  88.24 
 
 		 524 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  94.12 
 
 		 476 aa  880    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  80.46 
 
 		 476 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  78.02 
 
 		 486 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  68.76 
 
 		 474 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  67.83 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  66.96 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  65.05 
 
 		 470 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  66.96 
 
 		 478 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  67.93 
 
 		 476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  64.18 
 
 		 467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  63.31 
 
 		 471 aa  571  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  65.49 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  66.88 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  66.81 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  64.4 
 
 		 477 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  66.01 
 
 		 471 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  66.45 
 
 		 471 aa  558  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  63.64 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  59.96 
 
 		 479 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  61.74 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  61 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  62.17 
 
 		 477 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  62.36 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  56.61 
 
 		 480 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  57.17 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  58.68 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  59.12 
 
 		 444 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  58.12 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  55.16 
 
 		 471 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  58.26 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  53.01 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  49.55 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  47.52 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  47.53 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  50.11 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  47.87 
 
 		 465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  42.39 
 
 		 496 aa  292  7e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  42.95 
 
 		 477 aa  279  7e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  41.97 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  38.79 
 
 		 495 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  39.82 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  38.03 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  37.88 
 
 		 491 aa  256  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  37.68 
 
 		 488 aa  254  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  40 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  38.46 
 
 		 461 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  37.15 
 
 		 486 aa  246  9e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  38.25 
 
 		 497 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  37.14 
 
 		 467 aa  229  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  24.72 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  25.08 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  26.15 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  22.12 
 
 		 577 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>