69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1773 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  75.8 
 
 		 468 aa  695    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  75.91 
 
 		 477 aa  690    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  100 
 
 		 470 aa  921    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  74.12 
 
 		 471 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  73.03 
 
 		 470 aa  631  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  74.12 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  72.23 
 
 		 475 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  71.52 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  71.62 
 
 		 478 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  65.93 
 
 		 476 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  65.75 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  65.49 
 
 		 476 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  65.85 
 
 		 476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  65.13 
 
 		 476 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  65.7 
 
 		 476 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  65.7 
 
 		 476 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  65.47 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  65.7 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  65.47 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  65.47 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  65.47 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  68.64 
 
 		 476 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  65.25 
 
 		 524 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  65.25 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  65.79 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  65.85 
 
 		 467 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  64.38 
 
 		 476 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  62.2 
 
 		 469 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  61.76 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  63.36 
 
 		 476 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  61.37 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  61.74 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  63.3 
 
 		 486 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  60.09 
 
 		 496 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  57.05 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  58.77 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  57.05 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  59.87 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  57.49 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  55.48 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  53.74 
 
 		 480 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  58.8 
 
 		 447 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  55.58 
 
 		 471 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  54.97 
 
 		 476 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  53.83 
 
 		 444 aa  435  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  49.79 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  50.99 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  47.3 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  50.86 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  49.89 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  47.75 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  43.91 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  44.1 
 
 		 424 aa  282  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  41.03 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  37.83 
 
 		 495 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  39.05 
 
 		 497 aa  255  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  40.38 
 
 		 486 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  38.72 
 
 		 477 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  36.69 
 
 		 491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  37.76 
 
 		 488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  38.85 
 
 		 512 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  37.61 
 
 		 514 aa  239  8e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  37.55 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  38.11 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  24.61 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  24.92 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  23.63 
 
 		 577 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  23.57 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  24.31 
 
 		 423 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>