67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1314 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1314  Citrate transporter  100 
 
 
469 aa  927    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1157  hypothetical protein  55.31 
 
 
485 aa  502  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2717  hypothetical protein  49.79 
 
 
480 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0905  hypothetical protein  49.58 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000054356  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2715  hypothetical protein  49.26 
 
 
480 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1483  hypothetical protein  50.21 
 
 
479 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000529822  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3140  Citrate transporter  50.95 
 
 
477 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2935  hypothetical protein  49.06 
 
 
496 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2201  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  47.73 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00147689  normal  0.560702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2930  putative arsenite-anitmonite efflux pump, ArsB family  47.3 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4215  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  46.87 
 
 
476 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0682277  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0963  hypothetical protein  46.87 
 
 
469 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.788665  normal  0.0604629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10380  hypothetical protein  46.22 
 
 
467 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1518  hypothetical protein  48.16 
 
 
474 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2810  membrane protein  47.03 
 
 
502 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0120471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1102  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  47.3 
 
 
476 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1773  putative transmembrane protein  47.3 
 
 
470 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0623  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like  47.3 
 
 
476 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0180433  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0898  putative transmembrane protein  46.65 
 
 
469 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2282  transmembrane protein  47.73 
 
 
474 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1061  Na+/H+ antiporter NhaD or related arsenite permease  47.3 
 
 
476 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000238293  normal  0.324654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1822  putative transporter  46.61 
 
 
480 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0267037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2871  putative transporter  46.4 
 
 
502 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2783  putative transporter  46.61 
 
 
480 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0535075  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0512  hypothetical protein  46.61 
 
 
480 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2499  putative transporter  46.61 
 
 
480 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000791784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3079  putative transmembrane protein  47.67 
 
 
468 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514177  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2928  hypothetical protein  46.4 
 
 
524 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000987281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1621  putative transmembrane protein  48.84 
 
 
477 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4739  putative transmembrane protein  48.38 
 
 
475 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2491  putative transmembrane protein  49.26 
 
 
471 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0893781  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0978  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  47.3 
 
 
476 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1054  ArsB family arsenate permease  47.52 
 
 
476 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185444  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1699  hypothetical protein  46.61 
 
 
467 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0113729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1033  hypothetical protein  46.22 
 
 
478 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451323  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0569  hypothetical protein  45.45 
 
 
502 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0080395  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0982  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases-like protein  47.52 
 
 
476 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1369  putative transmembrane protein  49.58 
 
 
471 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0227855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1445  citrate transporter  49.26 
 
 
488 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2447  hypothetical protein  47.41 
 
 
476 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1990  hypothetical protein  45.36 
 
 
471 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000720766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2068  putative transmembrane protein  46.93 
 
 
470 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.183279  hitchhiker  0.00114382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1510  hypothetical protein  45.34 
 
 
478 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.569867  normal  0.155045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4283  hypothetical protein  46.97 
 
 
447 aa  359  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1790  Citrate transporter  43.31 
 
 
471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6854  putative Na+ antiporter precursor  43.67 
 
 
444 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1464  hypothetical protein  45.24 
 
 
477 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0810  citrate transporter  46.54 
 
 
486 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  0.232284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2979  Citrate transporter  44.02 
 
 
476 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3834  hypothetical protein  44.78 
 
 
465 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.521876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1994  hypothetical protein  41.27 
 
 
495 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301924  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0162  hypothetical protein  41.81 
 
 
491 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0354  hypothetical protein  40.53 
 
 
486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0118  hypothetical protein  41.09 
 
 
488 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.636345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3365  hypothetical protein  44.73 
 
 
496 aa  306  6e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1788  Citrate transporter  41.43 
 
 
497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1398  hypothetical protein  41.1 
 
 
461 aa  296  8e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2743  citrate transporter  38.68 
 
 
450 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30420  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  42.36 
 
 
477 aa  286  8e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1726  hypothetical protein  39.57 
 
 
467 aa  276  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.576326  normal  0.062576 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1246  hypothetical protein  38.97 
 
 
514 aa  274  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1249  Citrate transporter  39.16 
 
 
512 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.221461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3299  hypothetical protein  38.86 
 
 
452 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281391  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0469  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  36.09 
 
 
424 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  23.12 
 
 
440 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  24.09 
 
 
577 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.29 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>