75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2430 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2430  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  233  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.878455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  73.08 
 
 		 104 aa  159  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0229  L-rhamnose 1-epimerase  68.93 
 
 		 104 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187644  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6714  L-rhamnose 1-epimerase  69.23 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5813  L-rhamnose 1-epimerase  68.27 
 
 		 106 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641251  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  66.04 
 
 		 107 aa  147  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  66.99 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  63.73 
 
 		 106 aa  140  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2208  L-rhamnose 1-epimerase  62.75 
 
 		 106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5686  L-rhamnose 1-epimerase  60.19 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  57.69 
 
 		 104 aa  130  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  62.38 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1033  hypothetical protein  58.25 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.889586  normal  0.718477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0965  L-rhamnose 1-epimerase  56.31 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  56.86 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3401  L-rhamnose 1-epimerase  56.73 
 
 		 106 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207239  normal  0.325252 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1210  L-rhamnose 1-epimerase  55.77 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6634  L-rhamnose 1-epimerase  56.31 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6401  L-rhamnose 1-epimerase  56.31 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6232  L-rhamnose 1-epimerase  55.34 
 
 		 104 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3465  hypothetical protein  54.37 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.237628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09140  L-rhamnose 1-epimerase  56.25 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.435762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4230  L-rhamnose 1-epimerase  51.52 
 
 		 107 aa  110  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3700  protein of unknown function DUF718  49.49 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3493  L-rhamnose 1-epimerase  45.63 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1149  L-rhamnose 1-epimerase  42.72 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5353  L-rhamnose 1-epimerase  39.42 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4083  L-rhamnose 1-epimerase  40.38 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4129  L-rhamnose 1-epimerase  40.38 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4432  L-rhamnose 1-epimerase  40.38 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4292  L-rhamnose 1-epimerase  40.38 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4116  L-rhamnose 1-epimerase  40.38 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03787  L-rhamnose mutarotase  38.46 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4286  L-rhamnose 1-epimerase  40.78 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4257  L-rhamnose 1-epimerase  40.78 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  40.78 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4438  L-rhamnose 1-epimerase  39.81 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4372  L-rhamnose 1-epimerase  40.78 
 
 		 104 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4326  L-rhamnose 1-epimerase  39.81 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.272019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0417  L-rhamnose 1-epimerase  36.89 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3849  L-rhamnose 1-epimerase  39.81 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3759  L-rhamnose 1-epimerase  39.81 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0748  hypothetical protein  39.81 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0511039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4381  L-rhamnose 1-epimerase  40.21 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0496  L-rhamnose 1-epimerase  37.86 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4075  L-rhamnose 1-epimerase  38.83 
 
 		 104 aa  83.6  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3488  L-rhamnose 1-epimerase  35.92 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3612  L-rhamnose 1-epimerase  37.86 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3786  L-rhamnose 1-epimerase  37.5 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4393  hypothetical protein  30.19 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.278522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4480  hypothetical protein  30.19 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4774  hypothetical protein  30.19 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  25.24 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  32 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  30.09 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  34.02 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  26.32 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  28.57 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  30.63 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05800  hypothetical protein  30.1 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  31.88 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  27.38 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  24.76 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  26.51 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0885  protein of unknown function DUF718  25.96 
 
 		 118 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  25.69 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  25.69 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  29.09 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  27.16 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0564  protein of unknown function DUF718  33.75 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  24.77 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3484  protein of unknown function DUF718  24.21 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44979  predicted protein  23.85 
 
 		 210 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>