21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44979 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44979  predicted protein  100 
 
 
210 aa  443  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  39.06 
 
 
109 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  32.28 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  31.5 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3484  protein of unknown function DUF718  35.19 
 
 
107 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  35.94 
 
 
109 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  31.88 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  29.92 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  27.2 
 
 
114 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  25 
 
 
131 aa  59.7  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1446  hypothetical protein  31.5 
 
 
105 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0233  hypothetical protein  28.35 
 
 
93 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0538  hypothetical protein  31.5 
 
 
105 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161074  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  31.87 
 
 
106 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  23.85 
 
 
367 aa  51.6  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6714  L-rhamnose 1-epimerase  26.61 
 
 
106 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  27.17 
 
 
104 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5813  L-rhamnose 1-epimerase  27.17 
 
 
106 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641251  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  25 
 
 
107 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0965  L-rhamnose 1-epimerase  23.08 
 
 
104 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  25.58 
 
 
103 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>