51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3484 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3484  protein of unknown function DUF718  100 
 
 
107 aa  226  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1446  hypothetical protein  57.14 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  48.11 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  45.87 
 
 
110 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  47.22 
 
 
114 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  46.79 
 
 
109 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0538  hypothetical protein  57.14 
 
 
105 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161074  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  45.87 
 
 
109 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  46.67 
 
 
367 aa  103  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  37.74 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  45.57 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44979  predicted protein  35.19 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0233  hypothetical protein  39.62 
 
 
93 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  35.19 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  34.26 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  30.56 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0564  protein of unknown function DUF718  31.08 
 
 
101 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  32.58 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  32 
 
 
115 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0885  protein of unknown function DUF718  28.87 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  26.26 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  32.04 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  27.66 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05800  hypothetical protein  30.67 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  24.24 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  30.21 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  29.52 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4230  L-rhamnose 1-epimerase  27.27 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  23.91 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  23.68 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  23.16 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  29.03 
 
 
104 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1210  L-rhamnose 1-epimerase  22.62 
 
 
104 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03736  hypothetical protein  27.47 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03787  L-rhamnose mutarotase  27.47 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  31.96 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3849  L-rhamnose 1-epimerase  25.27 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3700  protein of unknown function DUF718  27.59 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0748  hypothetical protein  25.27 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0511039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3759  L-rhamnose 1-epimerase  25.27 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4381  L-rhamnose 1-epimerase  27.47 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4116  L-rhamnose 1-epimerase  27.47 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2430  hypothetical protein  24.21 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.878455  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4129  L-rhamnose 1-epimerase  27.47 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4083  L-rhamnose 1-epimerase  27.47 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4292  L-rhamnose 1-epimerase  27.47 
 
 
104 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4432  L-rhamnose 1-epimerase  27.47 
 
 
104 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0229  L-rhamnose 1-epimerase  23.16 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187644  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  29.17 
 
 
110 aa  40  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>