64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0885 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0885  protein of unknown function DUF718  100 
 
 
118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  62.5 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  61.32 
 
 
106 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  60.38 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  54.46 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  53.27 
 
 
107 aa  116  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  54.21 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  51.72 
 
 
118 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  52.78 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4393  hypothetical protein  54.37 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.278522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4480  hypothetical protein  54.37 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05800  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4774  hypothetical protein  54.46 
 
 
108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0801  protein of unknown function DUF718  45.71 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29620  hypothetical protein  48.51 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1149  L-rhamnose 1-epimerase  33.96 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5686  L-rhamnose 1-epimerase  32.08 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3401  L-rhamnose 1-epimerase  34.29 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207239  normal  0.325252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  30.56 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1033  hypothetical protein  30.48 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.889586  normal  0.718477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  33.03 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0496  L-rhamnose 1-epimerase  35.85 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3612  L-rhamnose 1-epimerase  37.14 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  28.71 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6232  L-rhamnose 1-epimerase  34.29 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0417  L-rhamnose 1-epimerase  34.91 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  29.13 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  32.65 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3484  protein of unknown function DUF718  28.87 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6401  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6634  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5813  L-rhamnose 1-epimerase  29.29 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641251  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6714  L-rhamnose 1-epimerase  29.29 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  36.79 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3488  L-rhamnose 1-epimerase  33.96 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  35.29 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  31.43 
 
 
104 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3849  L-rhamnose 1-epimerase  35.85 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0748  hypothetical protein  35.85 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0511039 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  27.1 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3759  L-rhamnose 1-epimerase  35.85 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4083  L-rhamnose 1-epimerase  30.77 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4116  L-rhamnose 1-epimerase  30.77 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4129  L-rhamnose 1-epimerase  30.77 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5353  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6243  hypothetical protein  30.59 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4292  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  29.29 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4432  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4075  L-rhamnose 1-epimerase  31.13 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  22.55 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0965  L-rhamnose 1-epimerase  36.36 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3786  L-rhamnose 1-epimerase  28.97 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  30.1 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2208  L-rhamnose 1-epimerase  30.77 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03736  hypothetical protein  27.18 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03787  L-rhamnose mutarotase  27.18 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2430  hypothetical protein  25.96 
 
 
112 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.878455  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4230  L-rhamnose 1-epimerase  24.27 
 
 
107 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0229  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187644  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  28.43 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00650  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>