45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29620 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29620  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  249  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4774  hypothetical protein  53 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0801  protein of unknown function DUF718  53.85 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4393  hypothetical protein  52 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.278522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4480  hypothetical protein  52 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  50.48 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  51.11 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0885  protein of unknown function DUF718  48.51 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  46.67 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  46.15 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  44.66 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05800  hypothetical protein  43.56 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  43.4 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  43.82 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  41.9 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  42.7 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3612  L-rhamnose 1-epimerase  33.01 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1149  L-rhamnose 1-epimerase  30.39 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  34.67 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0496  L-rhamnose 1-epimerase  29.35 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0417  L-rhamnose 1-epimerase  29.35 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  26.21 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  32.35 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3488  L-rhamnose 1-epimerase  29.35 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03736  hypothetical protein  26.47 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03787  L-rhamnose mutarotase  26.47 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5353  L-rhamnose 1-epimerase  26.47 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  28.43 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  27.45 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4230  L-rhamnose 1-epimerase  27.1 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3872  protein of unknown function DUF718  34.15 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0310507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4116  L-rhamnose 1-epimerase  24.51 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  26.47 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4292  L-rhamnose 1-epimerase  24.51 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4432  L-rhamnose 1-epimerase  24.51 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4129  L-rhamnose 1-epimerase  24.51 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4083  L-rhamnose 1-epimerase  24.51 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  31.67 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4381  L-rhamnose 1-epimerase  23.91 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3484  protein of unknown function DUF718  31.94 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  25.35 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1210  L-rhamnose 1-epimerase  23 
 
 		 104 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4075  L-rhamnose 1-epimerase  22.55 
 
 		 104 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>