65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0801 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0801  protein of unknown function DUF718  100 
 
 		 108 aa  219  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4774  hypothetical protein  56.19 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4480  hypothetical protein  55.24 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4393  hypothetical protein  55.24 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.278522  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  52.38 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  51.89 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  53.7 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29620  hypothetical protein  53.85 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  51.43 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  48.6 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  46.73 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  47.66 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0885  protein of unknown function DUF718  45.71 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  47.62 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  46.73 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05800  hypothetical protein  45.28 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  32.41 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  37.38 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  28.97 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  29.36 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  32.63 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5813  L-rhamnose 1-epimerase  30.48 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641251  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  26.36 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4230  L-rhamnose 1-epimerase  30.91 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0417  L-rhamnose 1-epimerase  31.13 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373765  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6714  L-rhamnose 1-epimerase  30.48 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  34.09 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  29.25 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0965  L-rhamnose 1-epimerase  29.41 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2208  L-rhamnose 1-epimerase  32.71 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  32.08 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0496  L-rhamnose 1-epimerase  30 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  32.95 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  30.21 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3612  L-rhamnose 1-epimerase  34.62 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1149  L-rhamnose 1-epimerase  28.57 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  33.33 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  32.93 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3488  L-rhamnose 1-epimerase  30.19 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  26.85 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  40.62 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  30.84 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  27.36 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1210  L-rhamnose 1-epimerase  33.02 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  33.7 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6401  L-rhamnose 1-epimerase  32.71 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6634  L-rhamnose 1-epimerase  32.71 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4129  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  39.36 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3401  L-rhamnose 1-epimerase  33.64 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207239  normal  0.325252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4083  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  29.91 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4116  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03787  L-rhamnose mutarotase  27.88 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4292  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03736  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4432  L-rhamnose 1-epimerase  28.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  32.32 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5686  L-rhamnose 1-epimerase  25.47 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6243  hypothetical protein  29.07 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  34.41 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5353  L-rhamnose 1-epimerase  27.88 
 
 		 104 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>