28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6243 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6243  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0757  protein of unknown function DUF718  50.5 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0571  protein of unknown function DUF718  46.6 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00650  hypothetical protein  42.16 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  34.58 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  31.07 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  34.29 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  27.88 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  34.83 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  31.73 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05800  hypothetical protein  32.32 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3314  protein of unknown function DUF718  30.77 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  32.14 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  28.85 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5813  L-rhamnose 1-epimerase  35.23 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641251  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6714  L-rhamnose 1-epimerase  34.09 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0564  protein of unknown function DUF718  30.1 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3700  protein of unknown function DUF718  31.11 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0885  protein of unknown function DUF718  30.59 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3456  hypothetical protein  29.81 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0229  L-rhamnose 1-epimerase  32.58 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187644  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2729  hypothetical protein  28.85 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.727532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4480  hypothetical protein  25.81 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4393  hypothetical protein  25.81 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.278522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  37.21 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  29.67 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  36.17 
 
 		 108 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  30 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>