18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0757 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0757  protein of unknown function DUF718  100 
 
 		 107 aa  214  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00650  hypothetical protein  67.65 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6243  hypothetical protein  50.5 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514773  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0571  protein of unknown function DUF718  38.24 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0564  protein of unknown function DUF718  32.98 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  36.11 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3700  protein of unknown function DUF718  33.96 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  36.36 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1033  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.889586  normal  0.718477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5686  L-rhamnose 1-epimerase  33.01 
 
 		 107 aa  43.9  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2208  L-rhamnose 1-epimerase  31.73 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  39.13 
 
 		 115 aa  43.5  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  32.69 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  32.53 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4230  L-rhamnose 1-epimerase  29 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  27.45 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  32.95 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  33.7 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>