63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3465 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3465  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  224  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.237628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1033  hypothetical protein  75 
 
 		 107 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.889586  normal  0.718477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5686  L-rhamnose 1-epimerase  72.12 
 
 		 107 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6634  L-rhamnose 1-epimerase  62.5 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6401  L-rhamnose 1-epimerase  62.5 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1210  L-rhamnose 1-epimerase  63.11 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6232  L-rhamnose 1-epimerase  61.54 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3401  L-rhamnose 1-epimerase  58.65 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207239  normal  0.325252 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5813  L-rhamnose 1-epimerase  58.59 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641251  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6714  L-rhamnose 1-epimerase  56.57 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3566  L-rhamnose 1-epimerase  56.57 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.478649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2598  hypothetical protein  55.34 
 
 		 104 aa  116  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.477414  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2981  L-rhamnose 1-epimerase  56.31 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0297257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2208  L-rhamnose 1-epimerase  51.96 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2430  hypothetical protein  54.37 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.878455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6270  L-rhamnose 1-epimerase  50 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1807  L-rhamnose 1-epimerase  50.5 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0965  L-rhamnose 1-epimerase  44.23 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2123  hypothetical protein  49.02 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0247927  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09140  L-rhamnose 1-epimerase  52.08 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.435762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4919  L-rhamnose 1-epimerase  45 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0331686  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0229  L-rhamnose 1-epimerase  49.04 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187644  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3700  protein of unknown function DUF718  50 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4230  L-rhamnose 1-epimerase  42.42 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1149  L-rhamnose 1-epimerase  39.39 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3493  L-rhamnose 1-epimerase  43.69 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0417  L-rhamnose 1-epimerase  39.39 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0496  L-rhamnose 1-epimerase  39.39 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0748  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0511039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3849  L-rhamnose 1-epimerase  40 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3759  L-rhamnose 1-epimerase  40 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3488  L-rhamnose 1-epimerase  37 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3786  L-rhamnose 1-epimerase  37 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4116  L-rhamnose 1-epimerase  36.36 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4083  L-rhamnose 1-epimerase  36.36 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4129  L-rhamnose 1-epimerase  36.36 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4432  L-rhamnose 1-epimerase  36.36 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5353  L-rhamnose 1-epimerase  35.35 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4292  L-rhamnose 1-epimerase  36.36 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4438  L-rhamnose 1-epimerase  36 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4286  L-rhamnose 1-epimerase  36 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4257  L-rhamnose 1-epimerase  36 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4372  L-rhamnose 1-epimerase  36 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4075  L-rhamnose 1-epimerase  38.38 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4326  L-rhamnose 1-epimerase  36 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.272019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4381  L-rhamnose 1-epimerase  36.56 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1358  L-rhamnose 1-epimerase  37.37 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03787  L-rhamnose mutarotase  34.34 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03736  hypothetical protein  34.34 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3612  L-rhamnose 1-epimerase  35.35 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3307  hypothetical protein  32.69 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  31.76 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3108  protein of unknown function DUF718  32.58 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1027  protein of unknown function DUF718  25.84 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2300  protein of unknown function DUF718  25.71 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.60391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0974  protein of unknown function DUF718  30.34 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  25.3 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  23.15 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3612  protein of unknown function DUF718  27.1 
 
 		 115 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175398  normal  0.641333 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2457  hypothetical protein  27.63 
 
 		 115 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0564  protein of unknown function DUF718  51.52 
 
 		 101 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4774  hypothetical protein  28.41 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01960  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>