141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0829 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0829  phosphopentomutase  100 
 
 		 399 aa  800    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.654335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0249  phosphopentomutase  72.36 
 
 		 398 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1596  phosphopentomutase  72.11 
 
 		 398 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1570  phosphopentomutase  66.83 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0277  phosphopentomutase  69.6 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2221  phosphopentomutase  67.91 
 
 		 394 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2985  phosphopentomutase  63.52 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  59.01 
 
 		 409 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  55.17 
 
 		 406 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  54.68 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  54.68 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  56.68 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  55.01 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  49.63 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  54.03 
 
 		 406 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  55.17 
 
 		 406 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4521  phosphopentomutase  57.64 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  56.14 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  49.63 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  49.38 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  49.38 
 
 		 404 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  49.63 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  49.38 
 
 		 404 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  47.9 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  53.59 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  50 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  50 
 
 		 407 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  50 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  53.94 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  47.41 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  48.03 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  49.02 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  49.38 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  46.65 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  48.64 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  49.14 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  47.3 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  50 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  49.74 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  48.64 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  48.53 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  48.65 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  47.92 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  47.9 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  48.28 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  48.04 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  48.53 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  48.04 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  49.39 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2813  phosphopentomutase  48.4 
 
 		 405 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00335296  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  47.91 
 
 		 406 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1027  phosphopentomutase  47.77 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  46.81 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  46.81 
 
 		 407 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  46.81 
 
 		 407 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  46.81 
 
 		 407 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  46.81 
 
 		 407 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  45.61 
 
 		 415 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  46.32 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0829  phosphopentomutase  50.61 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44144  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  44.25 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  46.53 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  46.23 
 
 		 392 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  42.08 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  43.84 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  45.19 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  44.42 
 
 		 397 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  44.22 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  46.55 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  43.31 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  42.47 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  42.47 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  42.47 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  42.47 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  42.47 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  44.25 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  42.47 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  43.07 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  42.47 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  42.47 
 
 		 395 aa  288  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  43.56 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  41.56 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  42.86 
 
 		 391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  44.83 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  41.73 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  40.59 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  40.59 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  44.54 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  41.67 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  43.73 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  44.36 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>