65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0145 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0145  heterodisulfide reductase subunit  100 
 
 		 61 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1278  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  67.8 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.264877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0865  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  49.02 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1973  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  41.38 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0089  heterodisulfide reductase subunit  45.1 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.633764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1199  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  43.14 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.461451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0148  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  47.06 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3584  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  47.06 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1110  hydrogenase, methyl-violgen-reducing type, delta subunit  45.1 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.906515  normal  0.318255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1259  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  39.22 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2015  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  45.28 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1305  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  41.18 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1653  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  44.23 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1784  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  41.51 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1030  hydrogenase, methyl-violgen-reducing type, delta subunit  39.22 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.485491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0566  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  41.51 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1329  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  41.51 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1332  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38.33 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.931866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0242  F420-non-reducing hydrogenase subunit D  51.92 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.307195  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0851  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  41.18 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1210  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  39.22 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2314  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  35.59 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0195  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  35.59 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2101  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  39.22 
 
 		 482 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0028  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  46.34 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1175  hypothetical protein  43.48 
 
 		 52 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0325  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  40 
 
 		 501 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0420  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  45.1 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0029  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  46.34 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1354  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  37.74 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.774154  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3527  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  39.22 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0829  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  38 
 
 		 494 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.330153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0823  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  38.46 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0099  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  40.38 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.585779  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2347  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  37.25 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3132  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  36.54 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3427  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  43.9 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2238  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  44.23 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.410649  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0979  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38.46 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000116298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1842  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  44.23 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3678  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  34.69 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358759  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2083  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  37.78 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0566289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1839  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  44.23 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2661  F420-non-reducing hydrogenase subunit D  34.69 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2148  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  30.77 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2806  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  37.78 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.515421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0399  hydrogenase, methyl-violgen-reducing type, delta subunit, selenocysteine-containing  40 
 
 		 52 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17780  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  35.29 
 
 		 173 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0622  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  40.38 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.316119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0552  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  35.29 
 
 		 786 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0563725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1975  hypothetical protein  37.78 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0587  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  39.62 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000161599  normal  0.0317358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2260  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  28.3 
 
 		 807 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0072  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  32 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4307  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  35.29 
 
 		 488 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.340367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3956  hypothetical protein  34.88 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1448  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  36.36 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0650  F420-non-reducing hydrogenase subunit D  30 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2154  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  36.73 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  29.41 
 
 		 792 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3014  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  30.61 
 
 		 252 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123543  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2972  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  30.61 
 
 		 252 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.13558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1283  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  30.77 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.475026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0115  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  35.29 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1793  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  32.14 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.944587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>