29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1975 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3014  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  54.82 
 
 		 252 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123543  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2972  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  54.82 
 
 		 252 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.13558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1180  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  26.09 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.536171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1259  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  42.55 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0029  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  36.99 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0028  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  48.78 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1305  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  40.43 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0865  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  37.5 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1175  hypothetical protein  48.78 
 
 		 52 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2148  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  46.81 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2806  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  23.75 
 
 		 255 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.515421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0851  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  34.78 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1199  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38.3 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.461451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0145  heterodisulfide reductase subunit  37.78 
 
 		 61 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3427  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  37.5 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1653  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  32.69 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0089  heterodisulfide reductase subunit  40.62 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.633764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0148  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  46.34 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3584  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  46.34 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1030  hydrogenase, methyl-violgen-reducing type, delta subunit  39.53 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.485491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1448  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  23.12 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1210  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  38.3 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2015  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  48.78 
 
 		 146 aa  42  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2083  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  23.42 
 
 		 212 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0566289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1110  hydrogenase, methyl-violgen-reducing type, delta subunit  37.21 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.906515  normal  0.318255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1278  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  37.78 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.264877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  35.29 
 
 		 792 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1332  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38.3 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.931866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>