56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1175 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1175  hypothetical protein  100 
 
 		 52 aa  104  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1784  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  47.06 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2015  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  50 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1278  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  44.68 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.264877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0145  heterodisulfide reductase subunit  43.48 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2148  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  50 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2101  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  43.18 
 
 		 482 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1210  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  40.43 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1653  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  40.74 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0865  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  45.24 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0089  heterodisulfide reductase subunit  45.24 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.633764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1199  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  44.19 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.461451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0148  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  45.24 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1259  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  46.51 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0195  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  40.43 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1793  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  46.81 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2314  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  40.43 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1193  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  47.83 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3584  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  45.24 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0851  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  41.3 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0029  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  45 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1030  hydrogenase, methyl-violgen-reducing type, delta subunit  41.86 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.485491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3427  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  45 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2347  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  48 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1802  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0028  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  45 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3956  hypothetical protein  48.78 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1975  hypothetical protein  48.78 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0552  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  38.1 
 
 		 786 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0563725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2806  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38.64 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.515421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3014  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  47.73 
 
 		 252 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123543  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1448  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38.64 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0878  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  47.06 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.340433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2972  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  47.73 
 
 		 252 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.13558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2083  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  34.69 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0566289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2238  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  37.5 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.410649  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1305  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  39.53 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1110  hydrogenase, methyl-violgen-reducing type, delta subunit  39.02 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.906515  normal  0.318255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2661  F420-non-reducing hydrogenase subunit D  40.91 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1329  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  39.58 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0829  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  40.91 
 
 		 494 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.330153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1157  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  50 
 
 		 51 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0979  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  34.04 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000116298  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0242  F420-non-reducing hydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.307195  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0325  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38.64 
 
 		 501 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3132  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  38.3 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3527  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  40 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0998  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  41.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1842  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  35.42 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0343  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  47.83 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1839  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  35.42 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0971  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  39.58 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1332  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  34.78 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.931866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  38.1 
 
 		 792 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0587  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  29.17 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000161599  normal  0.0317358 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1710  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>