81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2485 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2485  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
321 aa  625  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4789  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like  29.1 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0327  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  32.33 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  32.45 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  27.16 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  24.51 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  30.37 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 
349 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  29.21 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  35.63 
 
 
1003 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  38.55 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 
345 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  25 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  26.92 
 
 
568 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  36.84 
 
 
319 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  27.1 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  32.43 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  31.34 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  30.08 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  28.51 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  30 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0433  aminoglycoside phosphotransferase  25.32 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  29.24 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  31.49 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  34.13 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  29.13 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  26.77 
 
 
326 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  42.19 
 
 
323 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  31.64 
 
 
326 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  30.12 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  26.87 
 
 
316 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  31.9 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  39.13 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  39.44 
 
 
348 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  29.26 
 
 
320 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  30.37 
 
 
324 aa  46.2  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  35.48 
 
 
326 aa  45.8  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  31.28 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  31.78 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  36.73 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0121  homoserine kinase  28.44 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1768  aminoglycoside phosphotransferase  27.03 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5777  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6311  aminoglycoside phosphotransferase  27.03 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  36.96 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  32.76 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2990  aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  36.96 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  29.87 
 
 
981 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0136  homoserine kinase  29.68 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  27.74 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  33.12 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  34.52 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  39.13 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  24.56 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  28.43 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  35.87 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2485  Hygromycin-B kinase  54 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318408  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0138  homoserine kinase  28.44 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60387  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  27.82 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5107  homoserine kinase  28.77 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.171443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  29.87 
 
 
981 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  29.87 
 
 
981 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  28.81 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  30.18 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  36.62 
 
 
978 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0158  hypothetical protein  24.54 
 
 
234 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  28.26 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  29.54 
 
 
374 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  29.59 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  36.99 
 
 
329 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  29.8 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  23.53 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3845  aminoglycoside phosphotransferase  38.03 
 
 
348 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3762  aminoglycoside phosphotransferase  38.03 
 
 
348 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  26.14 
 
 
327 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  34.35 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3847  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
347 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.899944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>