48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0327 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0327  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 335 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  30.12 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2485  aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  29.39 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  26.69 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  29.92 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  30.08 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  27.38 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  28.57 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  27.8 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  28.25 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  26.99 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  28.95 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  25.68 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  25.82 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  25.26 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  28.62 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  27.1 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  28.36 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  25.45 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  24.82 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  25.55 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  24.91 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4789  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like  28.28 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  27.43 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  25.87 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  25.99 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  30.14 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  30.26 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0939  putative homoserine kinase type II  26.29 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000121623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  26.06 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  28.45 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  32.52 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  32.52 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  26.2 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  23.94 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  26.67 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  23 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0938  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  27.15 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  26.63 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  23.41 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  25.09 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  26.48 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2622  homoserine kinase  26.57 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  22.74 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0433  aminoglycoside phosphotransferase  24.62 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>