40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0939 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0939  putative homoserine kinase type II  100 
 
 		 396 aa  831    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000121623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  24.65 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  23.21 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  25.9 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  26.37 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  26.04 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  24.82 
 
 		 326 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  24.59 
 
 		 318 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  25.5 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  25.17 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  25.89 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  24.23 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  25.49 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  26.92 
 
 		 326 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  23.72 
 
 		 324 aa  50.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  22.18 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  24.82 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  22.86 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  25.41 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1580  Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  23.53 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  hitchhiker  9.565629999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2860  aminoglycoside phosphotransferase  23.46 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  26.72 
 
 		 320 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  24.91 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  21.02 
 
 		 323 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  21.02 
 
 		 323 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  24.36 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  21.02 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  23.3 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  23.16 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  24.18 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  22.44 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  26.4 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  24.73 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  34.34 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  20.68 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  31.25 
 
 		 317 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  24.8 
 
 		 321 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  20.68 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  25.38 
 
 		 334 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  22.89 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.031693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>