158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1695 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1695  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0403683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1728  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2222  ribosome-binding factor A  44.83 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3382  ribosome-binding factor A  39.76 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0271741  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  35.16 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  35.16 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  34.41 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0402  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  40.28 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1691  ribosome-binding factor A  23.6 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2749  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  36.67 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2427  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224227  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1248  ribosome-binding factor A  38.55 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0261774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2560  ribosome-binding factor A  38.55 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0072  ribosome-binding factor A  34.44 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1702  ribosome-binding factor A  36.9 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000429225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0072  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.884445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2991  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0708502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  37.65 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2010  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142179  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  41.57 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  33.73 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  41.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  41.57 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  31.46 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  41.57 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  38.27 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  31.76 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  31.31 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  39.77 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  36.47 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  38.16 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1413  ribosome-binding factor A  34.12 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  31.31 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  33.7 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  26.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  38.37 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  37.68 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1920  ribosome-binding factor A  34.52 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0348034  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  41.86 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  34.94 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0403  ribosome-binding factor A  36.56 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000114311  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  34.12 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0860  ribosome-binding factor A  30.95 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  31.18 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  30.34 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  31.18 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  37.08 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  43.18 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>