120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2222 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2222  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1695  ribosome-binding factor A  44.83 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0403683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  41.76 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0832  ribosome-binding factor A  29.79 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  36.46 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  34.74 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  39.19 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  39.19 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  35.87 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  32.63 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1702  ribosome-binding factor A  34.52 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000429225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  34.67 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  31.87 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1920  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0348034  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  30.85 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  30.85 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  30.85 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  32.05 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  34.67 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  40.96 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  38.82 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  33.75 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  37.33 
 
 		 132 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  32.18 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3059  ribosome-binding factor A  43.06 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.491319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  31.51 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1248  ribosome-binding factor A  36.25 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0261774  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2560  ribosome-binding factor A  36.25 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  34.07 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0072  ribosome-binding factor A  30.93 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  34.25 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  28.92 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  28.24 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0072  ribosome-binding factor A  29.9 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.884445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3388  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.990819  hitchhiker  0.00369045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  36.05 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  34.94 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2833  ribosome-binding factor A  40.28 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0402  ribosome-binding factor A  27.27 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  28.26 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1413  ribosome-binding factor A  31.76 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  38.55 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3382  ribosome-binding factor A  33.75 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0271741  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3238  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  30.49 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  30.49 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3279  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3416  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.523215  hitchhiker  0.00061048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1129  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0360009  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  32.63 
 
 		 127 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  30.56 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  30.95 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  35.37 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  34.52 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  36.14 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3560  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  34.12 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  32.58 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>