281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3382 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3382  ribosome-binding factor A  100 
 
 
125 aa  255  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0271741  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2560  ribosome-binding factor A  88.8 
 
 
125 aa  236  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1248  ribosome-binding factor A  88 
 
 
125 aa  234  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0261774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2427  ribosome-binding factor A  86.67 
 
 
122 aa  214  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224227  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2991  ribosome-binding factor A  80.49 
 
 
123 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0708502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2749  ribosome-binding factor A  82.11 
 
 
123 aa  213  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  83.33 
 
 
122 aa  209  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2010  ribosome-binding factor A  80.83 
 
 
122 aa  203  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142179  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1920  ribosome-binding factor A  75 
 
 
130 aa  189  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0348034  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  72.95 
 
 
120 aa  187  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1702  ribosome-binding factor A  69.42 
 
 
123 aa  180  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000429225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1728  ribosome-binding factor A  69.75 
 
 
143 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403197  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  64.52 
 
 
132 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  64.52 
 
 
132 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  64.52 
 
 
132 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  64.52 
 
 
132 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  64.52 
 
 
132 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  66.13 
 
 
132 aa  173  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  65.55 
 
 
121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  64.71 
 
 
121 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  66.12 
 
 
122 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  66.12 
 
 
122 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  66.12 
 
 
122 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  65.04 
 
 
138 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  65.04 
 
 
138 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  65.04 
 
 
138 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  65.04 
 
 
138 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  65.04 
 
 
138 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  63.25 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  57.72 
 
 
123 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1211  ribosome-binding factor A  56.1 
 
 
123 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1118  ribosome-binding factor A  56.1 
 
 
123 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  0.630529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  54.55 
 
 
122 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  53.28 
 
 
123 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1092  ribosome-binding factor A  52.94 
 
 
122 aa  133  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.378347  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  52.14 
 
 
122 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  54.13 
 
 
123 aa  120  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  53.15 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  49.17 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  54.1 
 
 
129 aa  116  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  52.25 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  46.72 
 
 
128 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  46.67 
 
 
129 aa  105  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  48.25 
 
 
129 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  47.97 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  47.97 
 
 
132 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  48.36 
 
 
132 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  47.97 
 
 
132 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  44.83 
 
 
138 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 
138 aa  100  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  46.9 
 
 
133 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 
129 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  46.9 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  47.9 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  40.68 
 
 
125 aa  87  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  40 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 
133 aa  84.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  40.68 
 
 
142 aa  84  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  44.21 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  41.9 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  39 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  40 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  36.67 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  35.83 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  36.64 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  35.59 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  40 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  35.59 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  38.66 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  38.71 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  36.29 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  32.69 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  38.66 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>