More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0131 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0131  Iojap-related protein  100 
 
 
128 aa  263  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.468906  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2225  iojap-like protein  50 
 
 
114 aa  107  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.194852  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  45.45 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  45.28 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  42.86 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  41.9 
 
 
118 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  41.59 
 
 
118 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  43 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  38.18 
 
 
191 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1339  iojap-like protein  42.86 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  38.05 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  38.39 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  41.35 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  39.42 
 
 
115 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  35 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  41.94 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  41.94 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  38.52 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  39.81 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  38 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  38 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  38 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  38 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  39.45 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  36 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  38.68 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  35.85 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  38.78 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  38.38 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  36 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  36 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  36 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  36 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  34.45 
 
 
261 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  36.45 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  36.79 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  37.5 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  37.74 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  34.48 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  43.3 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  33.61 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  41.18 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  38.24 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  35.51 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  32.65 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  32.82 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  33.33 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  37.14 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  34.86 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  34.29 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  36.45 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  36.45 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  29.91 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  28.97 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  41.58 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  39.22 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  33.96 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  38.68 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1149  iojap-like protein  35.58 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  35 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  35 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  35 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  37.27 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  33.06 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  31.82 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  35.19 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  36.19 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  30.97 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  40.38 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  37.62 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  40.21 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  36.19 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  32.65 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0801  iojap-like protein  37.25 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000037946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  36.19 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  35.92 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1233  iojap-like protein  36.94 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000702287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  40.59 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  34.26 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  31.86 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  34.55 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0778  iojap-like protein  36.27 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000818526  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  31.63 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  31.68 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  35.85 
 
 
117 aa  70.1  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  40.59 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  32.52 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  42.71 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  33.98 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  31.58 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  35.51 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  33.04 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  36.36 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  35.05 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  36.54 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  31.3 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>