More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4429 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4429  glutamate 5-kinase  100 
 
 		 347 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0426  glutamate 5-kinase  62.21 
 
 		 359 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6815  glutamate 5-kinase  58.72 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2338  glutamate 5-kinase  56.69 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.447048 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0460  glutamate 5-kinase  34.5 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0021893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  34.48 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1683  gamma-glutamyl kinase  35.24 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0321844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  33.53 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0894  gamma-glutamyl kinase  36.2 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  35.42 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  34.55 
 
 		 378 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  35.1 
 
 		 374 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  34.59 
 
 		 373 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  31.97 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  33.7 
 
 		 376 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1477  gamma-glutamyl kinase  36.53 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1101  gamma-glutamyl kinase  35.61 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  36.54 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  36.45 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  33.23 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  35.74 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  36.11 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  36.11 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  30.55 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1096  gamma-glutamyl kinase  34.86 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  31.31 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0643  gamma-glutamyl kinase  35.14 
 
 		 351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  32.42 
 
 		 379 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  33.54 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  33.05 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0618  gamma-glutamyl kinase  35.14 
 
 		 351 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  34.17 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  33.84 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  34.27 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  33.54 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  35.03 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  35.51 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  35.6 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  32.78 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  32.08 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  32.15 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  31.49 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  33.72 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  34.44 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1575  gamma-glutamyl kinase  32.56 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730383 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  32.92 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  33.03 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  30.11 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1506  glutamate 5-kinase  32.87 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.018123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  31.94 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  29.51 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  34.14 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  33.87 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  33.85 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1414  gamma-glutamyl kinase  33.74 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  32.93 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  32.93 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1864  gamma-glutamyl kinase  32.83 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  33.02 
 
 		 406 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  29.83 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13030  glutamate 5-kinase  31.47 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0917331  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  31.86 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  32.46 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  31.56 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  31.4 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  30.3 
 
 		 372 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  30.3 
 
 		 372 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  30.3 
 
 		 372 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  30.3 
 
 		 372 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  30.77 
 
 		 373 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1575  gamma-glutamyl kinase  33.43 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  33.55 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  29.56 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  30.56 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  31.13 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  33.55 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  30.72 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  28.45 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  30.56 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>