More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6815 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6815  glutamate 5-kinase  100 
 
 		 344 aa  695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2338  glutamate 5-kinase  68.31 
 
 		 344 aa  494  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.447048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0426  glutamate 5-kinase  60.47 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4429  glutamate 5-kinase  58.72 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  37.61 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  34.65 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  33.8 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  33.98 
 
 		 379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  34.57 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  34.24 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  33.98 
 
 		 376 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  35.34 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  33.43 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  37.3 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  32.02 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  33.7 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  35.14 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1477  gamma-glutamyl kinase  36.78 
 
 		 368 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  35.74 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  32.85 
 
 		 372 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  34.44 
 
 		 393 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  33.23 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  33.23 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  33.23 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  33.23 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  33.15 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  31.7 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  34.15 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  32.41 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  31.77 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0643  gamma-glutamyl kinase  36.56 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  34.09 
 
 		 367 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  34.66 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0460  glutamate 5-kinase  32.18 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0021893  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  34.66 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0618  gamma-glutamyl kinase  35.21 
 
 		 351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  34.42 
 
 		 367 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1096  gamma-glutamyl kinase  34.1 
 
 		 362 aa  165  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  35.74 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1101  gamma-glutamyl kinase  34.15 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  34.15 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  33.05 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  32.04 
 
 		 379 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  31.77 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  31.93 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  31.67 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  36.72 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  33.94 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  33.94 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  33.94 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  33.94 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  33.94 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  34.31 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  33.94 
 
 		 367 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  36.42 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13030  glutamate 5-kinase  32.49 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0917331  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  34.07 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  34.63 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  32.87 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  32.13 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  32.97 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2790  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.558621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  32.52 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  34.35 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  32.22 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  31.88 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  34.16 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  32.6 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  32.87 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  33.98 
 
 		 372 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  32.6 
 
 		 370 aa  155  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  32.7 
 
 		 386 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0894  gamma-glutamyl kinase  34.32 
 
 		 361 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  34.48 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1683  gamma-glutamyl kinase  33.23 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0321844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0068  gamma-glutamyl kinase  33.54 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  32.87 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  34.16 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  35.62 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  32.06 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  34.06 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  34.06 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  34.06 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  34.38 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  34.71 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  33.54 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>