More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1683 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1683  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 359 aa  734    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0321844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1101  gamma-glutamyl kinase  74.23 
 
 		 362 aa  556  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1864  gamma-glutamyl kinase  76.27 
 
 		 362 aa  554  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1096  gamma-glutamyl kinase  72.39 
 
 		 362 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0894  gamma-glutamyl kinase  67.69 
 
 		 361 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1575  gamma-glutamyl kinase  68.54 
 
 		 363 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730383 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1477  gamma-glutamyl kinase  66.85 
 
 		 368 aa  484  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  39.66 
 
 		 376 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  39.13 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.71 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  37.83 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1414  gamma-glutamyl kinase  39.55 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1575  gamma-glutamyl kinase  39.55 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  37.22 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  36.54 
 
 		 373 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  37.11 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  37.21 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  36.95 
 
 		 390 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  36.95 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  36.9 
 
 		 373 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  34.43 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  36.89 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 393 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  36.87 
 
 		 384 aa  219  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  35.16 
 
 		 378 aa  219  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  38.97 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  35.69 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  35.96 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  37.54 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  35.66 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  35.67 
 
 		 383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  36.62 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  35.31 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  35.67 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  35.48 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  34.25 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  36.16 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  33.71 
 
 		 370 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  35.6 
 
 		 369 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  35.25 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  36.55 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  35.45 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  35.13 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  33.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  33.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  34.05 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  35.77 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  33.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  33.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  34.89 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  33.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  36.66 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  34.96 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  33.81 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  34.84 
 
 		 373 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  36.26 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  33.24 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  34.25 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  32.7 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  33.98 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  35.83 
 
 		 375 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  34.63 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  33.88 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  34.25 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  35.21 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  34.63 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  33.7 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  35.16 
 
 		 379 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  36.34 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  34.07 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  35.86 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  35.62 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  33.87 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  34.33 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  35.31 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  35.89 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  35.96 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  34.79 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  34.58 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0460  glutamate 5-kinase  33.71 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0021893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  34.78 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  34.88 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  34.58 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  34.79 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  35.82 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  34.84 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  33.88 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>