More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1096 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1096  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
362 aa  740    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1101  gamma-glutamyl kinase  80.06 
 
 
362 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1683  gamma-glutamyl kinase  72.39 
 
 
359 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0321844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1864  gamma-glutamyl kinase  73.52 
 
 
362 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1575  gamma-glutamyl kinase  68.36 
 
 
363 aa  502  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0894  gamma-glutamyl kinase  66.76 
 
 
361 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1477  gamma-glutamyl kinase  63.07 
 
 
368 aa  473  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1414  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1575  gamma-glutamyl kinase  42.05 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  37.33 
 
 
372 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  36.64 
 
 
376 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  37.8 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  37.78 
 
 
373 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.72 
 
 
373 aa  232  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  37.8 
 
 
373 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  35.81 
 
 
373 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  38.42 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  36.26 
 
 
367 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  36.05 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  36.84 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  36.29 
 
 
387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  35.56 
 
 
374 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  34.93 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  36.44 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  36.52 
 
 
379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  33.6 
 
 
390 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  35.03 
 
 
393 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  34.69 
 
 
381 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  37.54 
 
 
366 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  34.58 
 
 
379 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  35.34 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  34.32 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  33.88 
 
 
376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  34.23 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  35.77 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  33.87 
 
 
373 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  35.05 
 
 
376 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  36.07 
 
 
372 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  34.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  34.45 
 
 
367 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  34.43 
 
 
372 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  35.5 
 
 
371 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  34.93 
 
 
369 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  35.33 
 
 
376 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  34.6 
 
 
390 aa  209  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  35.6 
 
 
369 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
375 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  33.86 
 
 
378 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  35.67 
 
 
372 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  34.26 
 
 
369 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  35.16 
 
 
375 aa  206  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  35.97 
 
 
372 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  35.46 
 
 
379 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  33.99 
 
 
372 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  33.99 
 
 
372 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  33.99 
 
 
372 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  33.99 
 
 
372 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  32.53 
 
 
382 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  34.93 
 
 
372 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  34.31 
 
 
378 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 
373 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  34.69 
 
 
374 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  31.97 
 
 
374 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  34.69 
 
 
379 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  32.05 
 
 
395 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  33.43 
 
 
370 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  34.37 
 
 
371 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  32.97 
 
 
371 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  34.37 
 
 
372 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  34.04 
 
 
379 aa  203  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
378 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
380 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  34.68 
 
 
374 aa  202  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
372 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  34.5 
 
 
379 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  34.88 
 
 
373 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  33.51 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  31.78 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  33.42 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  34.37 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  32.43 
 
 
376 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 
376 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  32.43 
 
 
376 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  33.88 
 
 
372 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0460  glutamate 5-kinase  34.86 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0021893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  34.78 
 
 
372 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>