More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0426 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0426  glutamate 5-kinase  100 
 
 
359 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776395  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4429  glutamate 5-kinase  62.21 
 
 
347 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6815  glutamate 5-kinase  60.47 
 
 
344 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2338  glutamate 5-kinase  57.85 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.447048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  37.54 
 
 
373 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  35.71 
 
 
366 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  35.78 
 
 
367 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  35.05 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  35.05 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  38.99 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  35.05 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  35.05 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  36.53 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  33.24 
 
 
373 aa  189  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
367 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
367 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
367 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
367 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
367 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
367 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  37.39 
 
 
367 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  34.12 
 
 
373 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  33.43 
 
 
369 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  35.38 
 
 
367 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  36.14 
 
 
370 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  36.01 
 
 
373 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  37.1 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  38.24 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  36.81 
 
 
377 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1096  gamma-glutamyl kinase  36.47 
 
 
362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  34.15 
 
 
373 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0894  gamma-glutamyl kinase  35.16 
 
 
361 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  37.5 
 
 
367 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  33.91 
 
 
372 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  37.5 
 
 
367 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  37.5 
 
 
367 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  33.43 
 
 
372 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  34.82 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  36.09 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  33.91 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  34.52 
 
 
373 aa  179  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  36.25 
 
 
369 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  35.48 
 
 
378 aa  179  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  35.71 
 
 
370 aa  179  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  36.25 
 
 
369 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1683  gamma-glutamyl kinase  34.41 
 
 
359 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0321844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  34.24 
 
 
372 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  36.31 
 
 
367 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
393 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  34.64 
 
 
369 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  36.79 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0460  glutamate 5-kinase  31.58 
 
 
343 aa  172  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0021893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  35.31 
 
 
371 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1477  gamma-glutamyl kinase  36.17 
 
 
368 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  32.46 
 
 
370 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08281  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 
360 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  36.06 
 
 
372 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  36.06 
 
 
372 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  32 
 
 
388 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  36.92 
 
 
370 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  34.99 
 
 
367 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  35.76 
 
 
372 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  36.68 
 
 
376 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  35.76 
 
 
367 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1575  gamma-glutamyl kinase  33.92 
 
 
363 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  35.96 
 
 
367 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  35.67 
 
 
373 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  35.45 
 
 
372 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0196  gamma-glutamyl kinase  33.22 
 
 
360 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  34.08 
 
 
369 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1101  gamma-glutamyl kinase  33.74 
 
 
362 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08491  gamma-glutamyl kinase  30.81 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  35.57 
 
 
367 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08521  gamma-glutamyl kinase  30.81 
 
 
360 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12466  gamma-glutamyl kinase  35.47 
 
 
376 aa  165  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0062273  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  32.84 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  35.61 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  33.71 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0618  gamma-glutamyl kinase  32.92 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0643  gamma-glutamyl kinase  32.92 
 
 
351 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  35.28 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0796  gamma-glutamyl kinase  31.56 
 
 
360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  34.17 
 
 
375 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  36.16 
 
 
372 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  36.1 
 
 
377 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07931  gamma-glutamyl kinase  31.18 
 
 
360 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2164  gamma-glutamyl kinase  35.89 
 
 
373 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1864  gamma-glutamyl kinase  33.04 
 
 
362 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2638  gamma-glutamyl kinase  35.2 
 
 
370 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  34.37 
 
 
378 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>