229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0487 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0487  acyltransferase 3  100 
 
 		 400 aa  817    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  30.53 
 
 		 351 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  30.51 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  26.59 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  27.32 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.07 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.07 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  32.16 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.67 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.67 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  26.23 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  26.59 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  35.85 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  34.46 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  23.11 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.73 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  24.11 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  34 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  31.94 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  33.12 
 
 		 583 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  32.18 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  36.25 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  28.45 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  24.21 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  34.36 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  32.93 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2850  acyltransferase 3  27.45 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  35.71 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  25.62 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  24.63 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  31.06 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  27.03 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  34.5 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  32.53 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  32.53 
 
 		 680 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  32.53 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.57 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  27.57 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  26.99 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  36.13 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  33.74 
 
 		 656 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  33.71 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  31.02 
 
 		 716 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  31.61 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  28.43 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  32.5 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  32.73 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  30.85 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  22.28 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  30.1 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  25.12 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  26.67 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  30.43 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  30.91 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  32.89 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  35.11 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  30 
 
 		 734 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  34.18 
 
 		 665 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  32.54 
 
 		 662 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  29.94 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  26.14 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.75 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  30.39 
 
 		 640 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  31.37 
 
 		 759 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  30.77 
 
 		 720 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2107  acyltransferase 3  32.92 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  31.76 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  28.92 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  34.88 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  29.35 
 
 		 742 aa  53.9  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  34.81 
 
 		 695 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  32.08 
 
 		 656 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.41 
 
 		 629 aa  53.5  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  31.06 
 
 		 683 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  24.8 
 
 		 380 aa  53.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  32.89 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  24.19 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  31.37 
 
 		 710 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  29.47 
 
 		 711 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  24.31 
 
 		 584 aa  52.8  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.63 
 
 		 634 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  24.19 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  29.3 
 
 		 695 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1626  acyltransferase family protein  24.19 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  34.52 
 
 		 673 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  24.19 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  28.88 
 
 		 654 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  29.9 
 
 		 658 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  31.55 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  29.75 
 
 		 695 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1402  acyltransferase family protein  24.19 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2128  acyltransferase family protein  24.19 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3186  acyltransferase family protein  24.19 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  29.7 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  33.77 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3022  acyltransferase 3  29.76 
 
 		 646 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399387  hitchhiker  0.00791396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  22.77 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  33.77 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  22.77 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  33.77 
 
 		 372 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>