88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1116 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1116  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
361 aa  742    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2074  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
374 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  32.53 
 
 
470 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
1523 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
544 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.07 
 
 
700 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
470 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  20.18 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  22.93 
 
 
1119 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
1267 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1414  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
269 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
279 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
470 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
1523 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  23.21 
 
 
291 aa  49.7  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
249 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.63 
 
 
1173 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  27.44 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.37 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
1267 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  39.77 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  20.19 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
243 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
374 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
270 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
841 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
1359 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 
314 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
282 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
312 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
332 aa  46.2  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
227 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.53 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
574 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2938  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  38.64 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
785 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  22.6 
 
 
1340 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.82 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  21.46 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
298 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 
324 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  35.23 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
487 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 
310 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  22.57 
 
 
315 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  23 
 
 
293 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
342 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  25.58 
 
 
312 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.11 
 
 
326 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
236 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
305 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  40.96 
 
 
513 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
328 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
332 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  20.49 
 
 
994 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>