More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3882 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
221 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187571  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0154  molybdenum ABC-transporter, permease protein (ModB)-like  49.53 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.491553  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.676119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0442  Fis family transcriptional regulator  46.92 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1542  putative transmembrane protein  49.05 
 
 
226 aa  168  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.09 
 
 
230 aa  165  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000677885  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.22 
 
 
223 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2673  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.89 
 
 
231 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.811966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50720  ABC transporter, permease protein  53.55 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.4 
 
 
235 aa  154  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  43.06 
 
 
222 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  43.06 
 
 
225 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.35 
 
 
221 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  42.31 
 
 
238 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  43.87 
 
 
222 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  44.23 
 
 
238 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.96 
 
 
221 aa  148  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.85 
 
 
226 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.29 
 
 
226 aa  148  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0552  molybdate ABC transporter, permease protein  44.57 
 
 
223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000347277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.64 
 
 
227 aa  144  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.96 
 
 
221 aa  144  9e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
224 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
233 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.93 
 
 
228 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.93 
 
 
228 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  43.5 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  43.24 
 
 
241 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1444  molybdate ABC transporter permease  48.1 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2102  molybdate ABC transporter, permease protein  43.72 
 
 
219 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  46.5 
 
 
225 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.57 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
221 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.78 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
225 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  39.02 
 
 
229 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  46 
 
 
225 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
225 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  43.5 
 
 
227 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.34 
 
 
226 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  39.02 
 
 
228 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.49 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
226 aa  131  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.1 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  37.38 
 
 
232 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  41.24 
 
 
229 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
226 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.88 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0707  molybdate ABC transporter permease  37.86 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437925  normal  0.189063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.69 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  40.91 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  39.29 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  40.72 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.46 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
220 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.9 
 
 
273 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.41 
 
 
271 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.82 
 
 
230 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  40.31 
 
 
269 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.76 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.46 
 
 
223 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  36.92 
 
 
229 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  38.35 
 
 
229 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
230 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 
222 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.41 
 
 
224 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  47.21 
 
 
224 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  38.42 
 
 
224 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.49 
 
 
282 aa  124  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.19 
 
 
224 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  37.5 
 
 
231 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.68 
 
 
259 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
226 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
226 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
226 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4396  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.14 
 
 
226 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00827136  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1369  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 
234 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.682424  normal  0.0893503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.32 
 
 
228 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
224 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.39 
 
 
226 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
226 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  35.98 
 
 
228 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
222 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.34 
 
 
227 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  38.42 
 
 
225 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0858  molybdate ABC transporter permease  39.32 
 
 
228 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
230 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1571  molybdenum ABC transporter, permease protein (ModB)  40.93 
 
 
226 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.602024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 
226 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 
226 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  34 
 
 
222 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  40.74 
 
 
231 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
230 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 
226 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>