More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1999 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
226 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.676119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0442  Fis family transcriptional regulator  80.91 
 
 
220 aa  344  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1542  putative transmembrane protein  73.36 
 
 
226 aa  295  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.64 
 
 
235 aa  288  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.41 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000677885  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0154  molybdenum ABC-transporter, permease protein (ModB)-like  50.91 
 
 
222 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.491553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2673  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.66 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.811966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0552  molybdate ABC transporter, permease protein  51.6 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000347277  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2102  molybdate ABC transporter, permease protein  50.27 
 
 
219 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1444  molybdate ABC transporter permease  51.22 
 
 
230 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50720  ABC transporter, permease protein  53.78 
 
 
231 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187571  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  44.55 
 
 
222 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  44.06 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
221 aa  144  9e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
221 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.69 
 
 
221 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
224 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.62 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  38.12 
 
 
238 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
221 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  37.31 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
226 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
226 aa  131  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
224 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  37.75 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  38.24 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.63 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 
241 aa  128  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.58 
 
 
231 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2053  molybdate ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
218 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37 
 
 
226 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.58 
 
 
224 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.8 
 
 
223 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  35.27 
 
 
229 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.74 
 
 
228 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2341  molybdate ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
218 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.302761  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.74 
 
 
228 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  41.67 
 
 
228 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.97 
 
 
235 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
224 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 
274 aa  121  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 
628 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.55 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
224 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  35.38 
 
 
226 aa  118  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.12 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  34.1 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  34.1 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.36 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.68 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  34.1 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  30.84 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.61 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  39.44 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  32.27 
 
 
266 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.74 
 
 
226 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
224 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  31.36 
 
 
266 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  33.64 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  30.88 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
224 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  31.13 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.36 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  31.22 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  35.08 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.3 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  37.91 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  35.08 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2565  molybdate ABC transporter, permease protein  42.63 
 
 
224 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0868  molybdate ABC transporter, permease protein  42.63 
 
 
224 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  36.87 
 
 
230 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0592  molybdate ABC transporter, permease protein  42.63 
 
 
224 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2428  molybdate ABC transporter, permease protein  42.63 
 
 
224 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0329  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.63 
 
 
224 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
227 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>