More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0858 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0858  molybdate ABC transporter permease  100 
 
 		 228 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  95.59 
 
 		 228 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0964  molybdate ABC transporter permease  93.86 
 
 		 229 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0707  molybdate ABC transporter permease  88.55 
 
 		 228 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437925  normal  0.189063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  78.54 
 
 		 229 aa  351  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.81 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4314  hypothetical protein  66.06 
 
 		 228 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.33 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  63.21 
 
 		 224 aa  272  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  67 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.09 
 
 		 227 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  62.93 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1379  molybdenum ABC transporter, permease protein  63.77 
 
 		 226 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.521789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2040  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.19 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2732  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.32 
 
 		 223 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3125  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.01 
 
 		 227 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.98 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.48 
 
 		 226 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2974  molybdate ABC transporter, permease protein  62.44 
 
 		 226 aa  254  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40410  molybdenum transport protein ModB  63.03 
 
 		 228 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1519  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.53 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.046514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.46 
 
 		 226 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129462  normal  0.0470639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3428  molybdenum transporter  62.09 
 
 		 228 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2942  molybdate ABC transporter permease  60.48 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.26 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.48 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  57.41 
 
 		 537 aa  248  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4417  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.58 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.569723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  58.94 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.83 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.37 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  61.86 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.34 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.75 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2887  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.35 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0388604  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2027  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.38 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3198  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.34 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.22 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  51.64 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03850  molybdenum ABC transporter, permease protein  53.05 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1571  molybdenum ABC transporter, permease protein (ModB)  59.2 
 
 		 226 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.602024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.35 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.68 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  52.85 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  54.95 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.07 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2153  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.03 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.70472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.24 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.7 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.74 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1877  molybdate ABC transporter inner membrane protein  51.81 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  43.81 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.95 
 
 		 224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0705  molybdate ABC transporter permease  44.95 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0618  ABC molybdenum transporter, inner membrane subunit ModB  43.3 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.19 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  43.32 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.34 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01052  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.32 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1060  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.21 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1057  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.69 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  39.72 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.26 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  40.74 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  40.19 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0223  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.03 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948647 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  39.63 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.9 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.92 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4396  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00827136  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0836  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0942  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.87 
 
 		 218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000896447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  42.73 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  42.73 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>