More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4640 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  100 
 
 
234 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  56.56 
 
 
224 aa  248  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.95 
 
 
232 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.48 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.02 
 
 
229 aa  240  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3428  molybdenum transporter  60.38 
 
 
228 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.01 
 
 
227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40410  molybdenum transport protein ModB  60.38 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  58.02 
 
 
226 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  54.95 
 
 
228 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1571  molybdenum ABC transporter, permease protein (ModB)  61.03 
 
 
226 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.602024  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.14 
 
 
227 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.43 
 
 
226 aa  234  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129462  normal  0.0470639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1519  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.21 
 
 
226 aa  234  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.046514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2974  molybdate ABC transporter, permease protein  58.96 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.55 
 
 
226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2942  molybdate ABC transporter permease  56.54 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2887  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.27 
 
 
226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0388604  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1379  molybdenum ABC transporter, permease protein  55.11 
 
 
226 aa  230  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.521789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3125  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.67 
 
 
227 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.11 
 
 
221 aa  229  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  59.18 
 
 
226 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.67 
 
 
226 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.67 
 
 
226 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  55.35 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  52.68 
 
 
237 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2040  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.36 
 
 
226 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.49 
 
 
225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.09 
 
 
230 aa  221  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  52.38 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  53.1 
 
 
537 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01052  molybdenum ABC transporter, permease protein  57.55 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569411  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.33 
 
 
230 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2027  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.44 
 
 
225 aa  215  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.39 
 
 
226 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.89 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03850  molybdenum ABC transporter, permease protein  52.36 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0858  molybdate ABC transporter permease  52.85 
 
 
228 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  51.96 
 
 
229 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3198  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.18 
 
 
226 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0707  molybdate ABC transporter permease  53.5 
 
 
228 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437925  normal  0.189063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0964  molybdate ABC transporter permease  51.81 
 
 
229 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4417  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.55 
 
 
221 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.569723  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.3 
 
 
222 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4314  hypothetical protein  50.99 
 
 
228 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.75 
 
 
225 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2732  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.27 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.42 
 
 
229 aa  198  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.55 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  48.85 
 
 
226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.75 
 
 
224 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1877  molybdate ABC transporter inner membrane protein  51.53 
 
 
224 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613271  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.69 
 
 
231 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.62 
 
 
222 aa  192  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.16 
 
 
222 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.89 
 
 
221 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.75 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.03 
 
 
224 aa  187  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.25 
 
 
226 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2153  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.35 
 
 
230 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.70472  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.06 
 
 
232 aa  185  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.48 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.71 
 
 
222 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.13 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0705  molybdate ABC transporter permease  42.66 
 
 
233 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0618  ABC molybdenum transporter, inner membrane subunit ModB  40.09 
 
 
233 aa  177  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 
220 aa  177  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  44.02 
 
 
224 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1057  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.2 
 
 
224 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1060  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.2 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  41.31 
 
 
221 aa  169  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  39.17 
 
 
225 aa  169  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
221 aa  169  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
226 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 
226 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
226 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 
224 aa  165  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
226 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0223  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.97 
 
 
252 aa  161  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.948647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.58 
 
 
226 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.58 
 
 
227 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.58 
 
 
226 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.58 
 
 
226 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.58 
 
 
226 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0836  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.38 
 
 
222 aa  158  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  41.06 
 
 
223 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
226 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
226 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
226 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  40.58 
 
 
226 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
226 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4396  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
226 aa  154  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00827136  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0162  molybdate ABC transporter permease  44.29 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171258  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  43.39 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0782  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.34 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254418  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0942  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 
218 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000896447  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  35.89 
 
 
232 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  36.14 
 
 
238 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>