More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2846 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  100 
 
 
537 aa  1090    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.07 
 
 
227 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  68.61 
 
 
228 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2040  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  71.56 
 
 
226 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40410  molybdenum transport protein ModB  72.73 
 
 
228 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1379  molybdenum ABC transporter, permease protein  68.47 
 
 
226 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.521789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  67.27 
 
 
226 aa  306  8.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3428  molybdenum transporter  72.25 
 
 
228 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2974  molybdate ABC transporter, permease protein  67.43 
 
 
226 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111033  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.86 
 
 
226 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129462  normal  0.0470639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.82 
 
 
225 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2942  molybdate ABC transporter permease  70.33 
 
 
226 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  63.95 
 
 
237 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  69.01 
 
 
224 aa  299  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.77 
 
 
226 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.35 
 
 
226 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.85 
 
 
226 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  69.85 
 
 
226 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.38 
 
 
229 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.72 
 
 
227 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3125  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.84 
 
 
227 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3198  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.85 
 
 
226 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1519  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.2 
 
 
226 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.046514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.35 
 
 
226 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2887  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.06 
 
 
226 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0388604  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03850  molybdenum ABC transporter, permease protein  62.44 
 
 
224 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  58.37 
 
 
229 aa  260  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.86 
 
 
232 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.33 
 
 
221 aa  256  9e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0979  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.83 
 
 
252 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2732  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.62 
 
 
223 aa  250  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2027  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.36 
 
 
225 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4314  hypothetical protein  58.9 
 
 
228 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.48 
 
 
228 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0858  molybdate ABC transporter permease  57.41 
 
 
228 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1571  molybdenum ABC transporter, permease protein (ModB)  59.46 
 
 
226 aa  246  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.602024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0964  molybdate ABC transporter permease  56.07 
 
 
229 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0707  molybdate ABC transporter permease  57.87 
 
 
228 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437925  normal  0.189063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2470  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  50.45 
 
 
253 aa  236  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2028  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.77 
 
 
264 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4417  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.46 
 
 
221 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.569723  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2756  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  45.12 
 
 
255 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0851797  normal  0.0478662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2973  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  47.41 
 
 
237 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2037  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  45.83 
 
 
250 aa  227  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.91 
 
 
230 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2941  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  44.21 
 
 
251 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3197  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44.14 
 
 
252 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.68 
 
 
228 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1283  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  49.14 
 
 
252 aa  224  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  54.33 
 
 
231 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.6 
 
 
228 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1476  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  45.41 
 
 
248 aa  220  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1520  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  45.62 
 
 
272 aa  220  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0302471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  53.1 
 
 
234 aa  219  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40390  molybdate-binding periplasmic protein precursor modA  46.46 
 
 
251 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3828  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  45.37 
 
 
252 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  54.5 
 
 
229 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1942  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.36 
 
 
252 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3543  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44.93 
 
 
252 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.020365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3427  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  45.37 
 
 
251 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4339  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.98 
 
 
258 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3124  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  45.95 
 
 
251 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.85 
 
 
230 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3545  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.38 
 
 
255 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.6 
 
 
229 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2888  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.46 
 
 
260 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0462664  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0449  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  41.06 
 
 
251 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50670  molybdenum transporter, periplasmic molybdate-binding protein  41.8 
 
 
252 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0706  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.98 
 
 
253 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.191825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.42 
 
 
224 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2080  molybdenum ABC transporter (substrate-binding protein)  46.55 
 
 
255 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1377  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.34 
 
 
249 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.54 
 
 
221 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2858  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.4 
 
 
251 aa  200  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.84 
 
 
220 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1837  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  45.69 
 
 
254 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62263  hitchhiker  0.0054087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.83 
 
 
224 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0963  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.32 
 
 
256 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4418  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.24 
 
 
250 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664379  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.5 
 
 
224 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1732  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.15 
 
 
259 aa  194  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839756  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1927  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.83 
 
 
253 aa  193  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.51 
 
 
224 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  45.83 
 
 
226 aa  189  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5198  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44.4 
 
 
257 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
232 aa  187  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0705  molybdate ABC transporter permease  45.97 
 
 
233 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1356  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  40.83 
 
 
253 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.09 
 
 
226 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1060  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.74 
 
 
224 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0618  ABC molybdenum transporter, inner membrane subunit ModB  43.97 
 
 
233 aa  182  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.19 
 
 
222 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
225 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
229 aa  180  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2153  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
230 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.70472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1057  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.69 
 
 
224 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 
221 aa  176  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  43.58 
 
 
221 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 
222 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 
222 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>