More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4396 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4396  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00827136  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  89.82 
 
 
226 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  89.82 
 
 
226 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  84.51 
 
 
226 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  82.3 
 
 
226 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  82.3 
 
 
226 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  82.3 
 
 
226 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  82.3 
 
 
226 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  81.86 
 
 
226 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  81.86 
 
 
226 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  80.53 
 
 
226 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  81.42 
 
 
226 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  80.53 
 
 
227 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.78 
 
 
226 aa  359  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  74.21 
 
 
225 aa  340  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  74.21 
 
 
223 aa  337  7e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  66.06 
 
 
226 aa  298  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0836  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.01 
 
 
222 aa  261  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.33 
 
 
222 aa  238  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0782  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
217 aa  211  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0162  molybdate ABC transporter permease  50.46 
 
 
222 aa  201  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171258  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.76 
 
 
220 aa  201  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 
224 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.58 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  43 
 
 
221 aa  178  7e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1057  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.77 
 
 
224 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.03 
 
 
231 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.66 
 
 
227 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1060  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.24 
 
 
224 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 
225 aa  176  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.89 
 
 
232 aa  175  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  45.63 
 
 
224 aa  175  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 
224 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3125  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.17 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  40.47 
 
 
226 aa  172  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
225 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 
224 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03850  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
224 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
222 aa  168  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.06 
 
 
228 aa  168  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 
227 aa  167  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
225 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 
229 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1877  molybdate ABC transporter inner membrane protein  43.43 
 
 
224 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1519  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 
226 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.046514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1379  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
226 aa  165  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.521789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
234 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.59 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2040  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2942  molybdate ABC transporter permease  40.78 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 
222 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.78 
 
 
226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.18 
 
 
231 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2732  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
223 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 
229 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01052  molybdenum ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
246 aa  158  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569411  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
230 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 
230 aa  158  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3428  molybdenum transporter  41.36 
 
 
228 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1571  molybdenum ABC transporter, permease protein (ModB)  44.1 
 
 
226 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.602024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2027  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.52 
 
 
225 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40410  molybdenum transport protein ModB  41.36 
 
 
228 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  39.32 
 
 
228 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.29 
 
 
226 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  41.46 
 
 
229 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.88 
 
 
226 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.88 
 
 
226 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  41.88 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  39.52 
 
 
537 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.6 
 
 
226 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  36.92 
 
 
224 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  39.81 
 
 
231 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2887  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
226 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0388604  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
228 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.17 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129462  normal  0.0470639 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
221 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  39.15 
 
 
226 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0942  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 
218 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000896447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2974  molybdate ABC transporter, permease protein  39.07 
 
 
226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  39.81 
 
 
226 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.49 
 
 
226 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  41.71 
 
 
229 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0858  molybdate ABC transporter permease  38.54 
 
 
228 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0618  ABC molybdenum transporter, inner membrane subunit ModB  38.6 
 
 
233 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0705  molybdate ABC transporter permease  39.53 
 
 
233 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  39.52 
 
 
237 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3198  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.88 
 
 
226 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0964  molybdate ABC transporter permease  39.02 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.05 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4314  hypothetical protein  39.68 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4417  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
221 aa  144  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.569723  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  37.79 
 
 
228 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
224 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>