More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0782 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0782  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
217 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.91 
 
 
222 aa  237  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0836  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.91 
 
 
222 aa  228  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  55.41 
 
 
226 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
227 aa  210  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  50.46 
 
 
223 aa  209  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.56 
 
 
226 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.39 
 
 
226 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  49.56 
 
 
226 aa  208  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.12 
 
 
226 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.12 
 
 
226 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.56 
 
 
226 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.56 
 
 
226 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.56 
 
 
226 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.12 
 
 
226 aa  207  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4396  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
226 aa  207  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00827136  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
226 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.46 
 
 
226 aa  205  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  51.39 
 
 
225 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.54 
 
 
226 aa  205  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0162  molybdate ABC transporter permease  53.55 
 
 
222 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171258  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.14 
 
 
224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.47 
 
 
232 aa  158  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
224 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1057  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 
224 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.86 
 
 
224 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1060  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.86 
 
 
224 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.15 
 
 
228 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.53 
 
 
225 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  46.23 
 
 
231 aa  151  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.91 
 
 
222 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 
226 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  43.75 
 
 
224 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  42.99 
 
 
228 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.86 
 
 
231 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.24 
 
 
230 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.21 
 
 
232 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.2 
 
 
226 aa  148  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1877  molybdate ABC transporter inner membrane protein  42.51 
 
 
224 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613271  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 
228 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03850  molybdenum ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.2 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1571  molybdenum ABC transporter, permease protein (ModB)  47.4 
 
 
226 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.602024  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
224 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.34 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2153  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.24 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.70472  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01052  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.2 
 
 
246 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.86 
 
 
226 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.08 
 
 
221 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  41.51 
 
 
238 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3125  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.4 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2732  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.6 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.59 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  44.79 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.69 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.24 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  45.45 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2040  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.34 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4314  hypothetical protein  43 
 
 
228 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2942  molybdate ABC transporter permease  41.26 
 
 
226 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1519  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.64 
 
 
226 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.046514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.6 
 
 
226 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  45.13 
 
 
226 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  39.06 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  43.78 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1379  molybdenum ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
226 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.521789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
225 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  42.05 
 
 
226 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  40.47 
 
 
226 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.05 
 
 
226 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
231 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.05 
 
 
226 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.52 
 
 
226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129462  normal  0.0470639 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.21 
 
 
222 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
227 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2974  molybdate ABC transporter, permease protein  44.92 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2027  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.65 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.43 
 
 
229 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0618  ABC molybdenum transporter, inner membrane subunit ModB  39.34 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2887  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.67 
 
 
226 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0388604  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4417  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.15 
 
 
221 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.569723  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  42 
 
 
537 aa  131  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3198  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.56 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.86 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.86 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  39.81 
 
 
237 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  39.62 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  43.11 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40410  molybdenum transport protein ModB  41.26 
 
 
228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0858  molybdate ABC transporter permease  43.65 
 
 
228 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0964  molybdate ABC transporter permease  44.2 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0705  molybdate ABC transporter permease  38.29 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3428  molybdenum transporter  41.7 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>