More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2673 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2673  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
231 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.811966  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1444  molybdate ABC transporter permease  77.63 
 
 
230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50720  ABC transporter, permease protein  61.11 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.66 
 
 
226 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.676119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0442  Fis family transcriptional regulator  52.88 
 
 
220 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0154  molybdenum ABC-transporter, permease protein (ModB)-like  53.18 
 
 
222 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.491553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1542  putative transmembrane protein  55.25 
 
 
226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.32 
 
 
235 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.26 
 
 
230 aa  184  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000677885  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0552  molybdate ABC transporter, permease protein  46.07 
 
 
223 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000347277  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2102  molybdate ABC transporter, permease protein  44.39 
 
 
219 aa  158  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
221 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187571  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  44.08 
 
 
222 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.93 
 
 
227 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.98 
 
 
223 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.62 
 
 
225 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
224 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.11 
 
 
227 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.47 
 
 
235 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
225 aa  148  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  39.44 
 
 
229 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  42.66 
 
 
238 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
224 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.13 
 
 
224 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
224 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.28 
 
 
224 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  40.83 
 
 
238 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 
224 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  32.88 
 
 
224 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 
222 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  33.03 
 
 
229 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  33.03 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.87 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  32.57 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  39.05 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  37.26 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.95 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  39.05 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  38.39 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.06 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.25 
 
 
226 aa  138  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 
282 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1060  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.68 
 
 
224 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 
226 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 
226 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.49 
 
 
221 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 
222 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
226 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  36.79 
 
 
226 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
233 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  36.32 
 
 
228 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 
226 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
221 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 
221 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
227 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.02 
 
 
221 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  40.91 
 
 
231 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  40.91 
 
 
231 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  36.74 
 
 
231 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.34 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
262 aa  134  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  35.38 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.11 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  40.57 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  35.81 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  40.19 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.59 
 
 
229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  40.91 
 
 
231 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1877  molybdate ABC transporter inner membrane protein  38.24 
 
 
224 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613271  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 
224 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1057  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.62 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
228 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
228 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  38.99 
 
 
231 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  34.82 
 
 
270 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  37.98 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.97 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  39.62 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.09 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  38.43 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  40.23 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.06 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>