More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1637 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000677885  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0442  Fis family transcriptional regulator  58.14 
 
 
220 aa  244  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.28 
 
 
235 aa  234  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.41 
 
 
226 aa  232  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.676119  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1542  putative transmembrane protein  55.45 
 
 
226 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0154  molybdenum ABC-transporter, permease protein (ModB)-like  49.76 
 
 
222 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.491553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2673  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 
231 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.811966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0552  molybdate ABC transporter, permease protein  51.05 
 
 
223 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000347277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50720  ABC transporter, permease protein  55.03 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
221 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187571  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2102  molybdate ABC transporter, permease protein  47.9 
 
 
219 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1444  molybdate ABC transporter permease  49.21 
 
 
230 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
224 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
227 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
233 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  41.26 
 
 
225 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.69 
 
 
226 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  36.82 
 
 
238 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
223 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 
223 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  40.51 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  40.27 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
225 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  39.73 
 
 
225 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
225 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.99 
 
 
221 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.99 
 
 
221 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  39.63 
 
 
222 aa  135  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 
235 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.8 
 
 
274 aa  132  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.27 
 
 
227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 
224 aa  126  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.21 
 
 
226 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
229 aa  125  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.58 
 
 
224 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.58 
 
 
224 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.1 
 
 
273 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.19 
 
 
293 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0618  ABC molybdenum transporter, inner membrane subunit ModB  33.62 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  38.83 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  37.82 
 
 
602 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.93 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.17 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  34.22 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.53 
 
 
221 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.1 
 
 
226 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.62 
 
 
221 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.41 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  30.36 
 
 
270 aa  118  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.13 
 
 
278 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.62 
 
 
221 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.43 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.54 
 
 
224 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.18 
 
 
299 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.18 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
628 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3756  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.27 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  32.16 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.82 
 
 
284 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.33 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1635  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.18 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  40.57 
 
 
228 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.88 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  34.84 
 
 
537 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
282 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.13 
 
 
297 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.03 
 
 
221 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.13 
 
 
306 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.85 
 
 
230 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.13 
 
 
297 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4088  polysaccharide export protein  34.09 
 
 
279 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101815 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.13 
 
 
297 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2950  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.28 
 
 
277 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.529327 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2341  molybdate ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 
218 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.302761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4886  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
225 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186941 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.13 
 
 
297 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2053  molybdate ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 
218 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  32.16 
 
 
266 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  34.29 
 
 
287 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>