More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2053 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2053  molybdate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
218 aa  423  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2341  molybdate ABC transporter, permease protein  98.62 
 
 
218 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.302761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.51 
 
 
224 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.65 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.19 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  38.39 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  41.38 
 
 
228 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  40.39 
 
 
229 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
223 aa  168  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  41 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
241 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  41 
 
 
231 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  41 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  40.76 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
221 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  40.38 
 
 
229 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
229 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.7 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  41.4 
 
 
601 aa  161  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  38 
 
 
222 aa  161  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 
224 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  36.87 
 
 
224 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.09 
 
 
221 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  36.7 
 
 
224 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 
224 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  36.7 
 
 
229 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.41 
 
 
224 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  36.24 
 
 
224 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  36.41 
 
 
224 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  40.19 
 
 
229 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  37.33 
 
 
232 aa  158  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 
221 aa  158  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  40.28 
 
 
602 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.36 
 
 
230 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
221 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  38.79 
 
 
228 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  37.27 
 
 
230 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  34.15 
 
 
238 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.03 
 
 
221 aa  154  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 
225 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  34.63 
 
 
238 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
226 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
221 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 
226 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  41.3 
 
 
221 aa  152  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  39.71 
 
 
229 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
221 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
228 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
228 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
225 aa  148  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  36.41 
 
 
227 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  40.67 
 
 
229 aa  148  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1860  molybdenum ABC transporter, permease protein ModB  38.38 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  38.97 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  38.97 
 
 
245 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.31 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  40.8 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.31 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  38.5 
 
 
245 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 
229 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
229 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
229 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
229 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
229 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
229 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
229 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
229 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
229 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
229 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
229 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  36.23 
 
 
224 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
227 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
240 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 
227 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  34.56 
 
 
231 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
233 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
245 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
225 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  35.29 
 
 
225 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
225 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  39.3 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  37.67 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  39.3 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 
604 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  35.29 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 
604 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  37.7 
 
 
236 aa  139  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
616 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  32.73 
 
 
233 aa  137  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  35.45 
 
 
230 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
220 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>