82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0423 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0423  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0379  hypothetical protein  63.31 
 
 		 190 aa  207  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0314  hypothetical protein  60.47 
 
 		 183 aa  200  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0309  protein of unknown function DUF477  59.88 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0329  hypothetical protein  47.78 
 
 		 180 aa  167  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4855  protein of unknown function DUF477  50.29 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1072  hypothetical protein  48.82 
 
 		 173 aa  157  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0257  hypothetical protein  50.62 
 
 		 176 aa  154  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3954  hypothetical protein  43.03 
 
 		 165 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.670415  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0104  hypothetical protein  43.18 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2692  hypothetical protein  45.56 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1763  protein of unknown function DUF477  40.72 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.479141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3712  hypothetical protein  43.51 
 
 		 165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1719  hypothetical protein  45.95 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.912604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1509  hypothetical protein  42.94 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6687  hypothetical protein  42.94 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0251309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2521  protein of unknown function DUF477  51.08 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0286  hypothetical protein  46.92 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0660  protein of unknown function DUF477  41.92 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2117  hypothetical protein  41.92 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442514  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6200  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0315  hypothetical protein  46.92 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0510  hypothetical protein  46.92 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0328  hypothetical protein  46.92 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3042  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2050  hypothetical protein  46.15 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.978311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3372  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5309  protein of unknown function DUF477  41.46 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2234  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3400  hypothetical protein  41.1 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.358552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1697  protein of unknown function DUF477  41.46 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0417  hypothetical protein  41.5 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1335  hypothetical protein  37.72 
 
 		 165 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4546  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.059315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1904  hypothetical protein  42.28 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2048  hypothetical protein  43.61 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  0.953122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3393  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.391181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04651  hypothetical protein  47.86 
 
 		 143 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.024621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0663  hypothetical protein  37.75 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0662  hypothetical protein  39.46 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2628  hypothetical protein  36.91 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0605  protein of unknown function DUF477  37.5 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1188  hypothetical protein  37.91 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0553  protein of unknown function DUF477  36.81 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0600  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0455  hypothetical protein  31.13 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3603  protein of unknown function DUF477  31.39 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5848  protein of unknown function DUF477  29.91 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04775  hypothetical protein  25.69 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1822  protein of unknown function DUF477  27.68 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0121907  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0010  hypothetical protein  30.53 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3703  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1402  protein of unknown function DUF477  26.76 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1890  hypothetical protein  23.13 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4335  protein of unknown function DUF477  24.29 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.533336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3876  hypothetical protein  34.07 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2278  hypothetical protein  26.92 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1796  protein of unknown function DUF477  25.96 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0823313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2421  protein of unknown function DUF477  24.04 
 
 		 215 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4748  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0550887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2034  hypothetical protein  26.42 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2295  protein of unknown function DUF477  29.67 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3228  hypothetical protein  29.73 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3452  hypothetical protein  30.48 
 
 		 226 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.562594  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0415  protein of unknown function DUF477  26.14 
 
 		 215 aa  47.8  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2025  protein of unknown function DUF477  25.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2018  hypothetical protein  31.52 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1479  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0815961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1231  protein of unknown function DUF477  29.07 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0259656 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0395  hypothetical protein  26.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1980  protein of unknown function DUF477  28.57 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47050  hypothetical protein  28.28 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1083  hypothetical protein  25.56 
 
 		 213 aa  44.7  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2020  hypothetical protein  25.58 
 
 		 216 aa  44.3  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000109583  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0877  hypothetical protein  35.45 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0941608  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0989  hypothetical protein  29.87 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2528  hypothetical protein  21.62 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0293183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6374  hypothetical protein  32.53 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2030  protein of unknown function DUF477  26.83 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1771  hypothetical protein  25.26 
 
 		 251 aa  41.6  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1373  hypothetical protein  24.42 
 
 		 211 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000592916  hitchhiker  0.000147717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>