104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6374 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6374  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1223  protein of unknown function DUF477  78.95 
 
 		 210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3876  hypothetical protein  65.87 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2295  protein of unknown function DUF477  49.52 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1980  protein of unknown function DUF477  51.44 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2018  hypothetical protein  49.04 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2034  hypothetical protein  41.04 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1231  protein of unknown function DUF477  36.98 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0259656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3991  hypothetical protein  32.84 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296881  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4288  hypothetical protein  32.35 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1300  hypothetical protein  33.17 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0959913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4748  hypothetical protein  36.87 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0550887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1083  hypothetical protein  31.94 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3480  hypothetical protein  34.2 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1404  hypothetical protein  37.76 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1820  hypothetical protein  31.6 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0813  hypothetical protein  30.2 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1752  hypothetical protein  31.6 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1373  hypothetical protein  35.24 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000592916  hitchhiker  0.000147717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4407  hypothetical protein  37.24 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.809369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3452  hypothetical protein  31.36 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.562594  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2025  protein of unknown function DUF477  30.33 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2421  protein of unknown function DUF477  34.47 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0989  hypothetical protein  31.86 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1796  protein of unknown function DUF477  34.63 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0823313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2278  hypothetical protein  29.86 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166997  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1671  hypothetical protein  38.17 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0119558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1045  hypothetical protein  33.67 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3228  hypothetical protein  33.49 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2362  protein of unknown function DUF477  30.1 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0549587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4319  hypothetical protein  37.76 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2030  protein of unknown function DUF477  33.33 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47050  hypothetical protein  33.66 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1771  hypothetical protein  26.51 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2528  hypothetical protein  27.98 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0293183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0877  hypothetical protein  41.22 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0941608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2020  hypothetical protein  28.64 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000109583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1479  hypothetical protein  38.12 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0815961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0415  protein of unknown function DUF477  29.8 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1822  protein of unknown function DUF477  28.8 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0121907  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0869  hypothetical protein  37.78 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1402  protein of unknown function DUF477  29.05 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3400  hypothetical protein  36.89 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.358552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1420  protein of unknown function DUF477  30.92 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3954  hypothetical protein  34.95 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.670415  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1763  protein of unknown function DUF477  33.01 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.479141  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1719  hypothetical protein  37.61 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.912604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2117  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0914  protein of unknown function DUF477  34.34 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0104  hypothetical protein  34.26 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1697  protein of unknown function DUF477  34.65 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5309  protein of unknown function DUF477  34.65 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0918  protein of unknown function DUF477  34.85 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0411456  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4546  hypothetical protein  31.4 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.059315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1904  hypothetical protein  34.69 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3712  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0417  hypothetical protein  28.3 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0314  hypothetical protein  34.55 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2692  hypothetical protein  35.64 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6687  hypothetical protein  35.05 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0251309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1072  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2048  hypothetical protein  30.69 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  0.953122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0309  protein of unknown function DUF477  34.55 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137525  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6200  hypothetical protein  28.85 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1227  protein of unknown function DUF477  30.54 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1232  protein of unknown function DUF477  27.22 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0663  hypothetical protein  36.36 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1335  hypothetical protein  32.04 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1188  hypothetical protein  32.04 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0286  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04651  hypothetical protein  36.19 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.024621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0379  hypothetical protein  36.11 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0926  hypothetical protein  32.04 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4855  protein of unknown function DUF477  33.33 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0257  hypothetical protein  30.69 
 
 		 176 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1509  hypothetical protein  30.69 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0510  hypothetical protein  34.41 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0328  hypothetical protein  34.41 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0423  hypothetical protein  31.53 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0010  hypothetical protein  32.99 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0329  hypothetical protein  30.28 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2628  hypothetical protein  32.32 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0600  hypothetical protein  28.15 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.978311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2234  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0315  hypothetical protein  34.29 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3393  hypothetical protein  26.85 
 
 		 165 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.391181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3603  protein of unknown function DUF477  27 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3703  hypothetical protein  24.21 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1890  hypothetical protein  20.71 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0605  protein of unknown function DUF477  31.46 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5848  protein of unknown function DUF477  24.24 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0455  hypothetical protein  24.73 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0411  hypothetical protein  23.93 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04775  hypothetical protein  20.71 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4335  protein of unknown function DUF477  23.61 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.533336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0553  protein of unknown function DUF477  30.34 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>