26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5233 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5233  TonB family protein  100 
 
 		 385 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  30.85 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  30.32 
 
 		 301 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  36.36 
 
 		 298 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  35.35 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  37.37 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0593  TonB-like protein  25.91 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.67 
 
 		 2449 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  34.31 
 
 		 301 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  33.05 
 
 		 319 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  36.36 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  32.77 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  36.36 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  31.63 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  30.23 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  35.35 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4555  TonB-like protein  33.33 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248985  normal  0.0574394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  26.72 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.17 
 
 		 3409 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  37.21 
 
 		 88 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  39.06 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  31.91 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  26.12 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  25.88 
 
 		 281 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  25.75 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.5 
 
 		 1888 aa  43.1  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>